RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 NEFLP07196 543 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP4AP20648 1035 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-210ENST00000590211 PLA2G4AP47712 749 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-210ENST00000590211 IER5Q5VY09 327 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-210ENST00000590211 XKR5Q6UX68 686 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-210ENST00000590211 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-210ENST00000590211 MCF2L2Q86YR7 1114 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-210ENST00000590211 SUSD3Q96L08 255 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-210ENST00000590211 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-210ENST00000590211 OSBPL7Q9BZF2 842 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-210ENST00000590211 GGT7Q9UJ14 662 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa5.97□□□□□ -1.45
CAPNS1-210ENST00000590211 INPP5BP32019 993 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 USPL1Q5W0Q7 1092 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 PI16Q6UXB8 463 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 VPS37DQ86XT2 251 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC16Q8NEE8 873 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 HPS1Q92902 700 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 HSH2DQ96JZ2 352 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 C12orf49Q9H741 205 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 TBX22Q9Y458 520 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 V9GY48 417 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 ARAP1Q96P48 1450 aa5.96□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0G2JS52 829 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 GIPC1O14908 333 aa5.95□□□□□ -1.46
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CAPNS1-210ENST00000590211 FGRP09769 529 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 IDH3AP50213 366 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 SOGA3Q5TF21 947 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 RHPN1Q8TCX5 695 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 ZIC5Q96T25 663 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 PDS5BQ9NTI5 1447 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM13BQ9NYF5 915 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 USP20Q9Y2K6 914 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFRSF21O75509 655 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 IRS1P35568 1242 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 PHKA2P46019 1235 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 GJA8P48165 433 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 GNASQ5JWF2 1037 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC27A3Q5K4L6 730 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 SDE2Q6IQ49 451 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFRSF10AO00220 468 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 STK10O94804 968 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR20EP86478 221 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR20CP86479 221 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR20DP86480 221 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR20BP86481 221 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR20AP86496 221 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 POU4F2Q12837 409 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 PAK2Q13177 524 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP4X1Q8N118 509 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 NLGN1Q8N2Q7 840 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF217Q8TC41 542 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.464e-6■□□□□ 9.2
CAPNS1-210ENST00000590211 OSBPL2Q9H1P3 480 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 CHRDQ9H2X0 955 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 PBRM1Q86U86 1689 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 IGF1RP08069 1367 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L7P0C7H9 530 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 ARSDP51689 593 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 MMRN1Q13201 1228 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 HIF1AQ16665 826 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 NBPF1Q3BBV0 1214 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR44Q5JSH3 913 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 ERMP1Q7Z2K6 904 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 BTLAQ7Z6A9 289 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 AIDAQ96BJ3 306 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 COPRSQ9NQ92 184 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM63CQ9P1W3 806 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 EFCAB5A4FU69 1503 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP43Q8NDM7 1665 aa5.91□□□□□ -1.46
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