RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 MICALL2Q8IY33 904 aa15.52■□□□□ 0.08
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CAPNS1-209ENST00000590049 C1orf141Q5JVX7 400 aa15.51■□□□□ 0.07
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CAPNS1-209ENST00000590049 IRS2Q9Y4H2 1338 aa15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 RPS12P25398 132 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 CAP1Q01518 475 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 YDJCA8MPS7 323 aa15.35■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CAPNS1-209ENST00000590049 MORC1Q86VD1 984 aa15.35■□□□□ 0.05
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