RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 LTBP3Q9NS15 1303 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 SOX10P56693 466 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 CA12O43570 354 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 ST5P78524 1137 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 PDE3AQ14432 1141 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 PDIA6Q15084 440 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 PROSER3Q2NL68 480 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 TPTE2Q6XPS3 522 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 ITPRIPQ8IWB1 547 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 CCDC191Q8NCU4 936 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 LINS1Q8NG48 757 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 MYD88Q99836 296 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 RNF123Q5XPI4 1314 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 CARMIL3Q8ND23 1372 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 AOC2O75106 756 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 ALDH1L1O75891 902 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 GNAI3P08754 354 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 PDE6BP35913 854 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 MAP2K2P36507 400 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 RRP1P56182 461 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 TCIRG1Q13488 830 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 BICDL1Q6ZP65 573 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 TTLL7Q6ZT98 887 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 DDX19BQ9UMR2 479 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-218ENST00000550159 CAMTA2O94983 1202 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 AAMPQ13685 434 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 CLUAP1Q96AJ1 413 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 ZNF541Q9H0D2 1346 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP12.07□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 SOGA3Q5TF21 947 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 G2E3Q7L622 706 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 CCDC24Q8N4L8 307 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 CNBD1Q8NA66 436 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 BRIP1Q9BX63 1249 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 BCL2L12Q9HB09 334 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 TRIM27P14373 513 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 GPTP24298 496 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 CNKSR1Q969H4 720 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 SCN4AP35499 1836 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 F6X3S4 739 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 CST9Q5W186 159 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 SH3TC1Q8TE82 1336 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 DLEC1Q9Y238 1755 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 FAM177BA6PVY3 158 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 TRAF5O00463 557 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 TLL2Q9Y6L7 1015 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 NEURL1BA8MQ27 555 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 GRM8O00222 908 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 PLIN1O60240 522 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 GCKRQ14397 625 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 MVPQ14764 893 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 HLFQ16534 295 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 TBC1D9BQ66K14 1250 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 STYK1Q6J9G0 422 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 LRP10Q7Z4F1 713 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 GCC1Q96CN9 775 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 NLRP3Q96P20 1036 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 ABCC4O15439 1325 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-218ENST00000550159 THSD7BQ9C0I4 1608 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-218ENST00000550159 HMMRO75330 724 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-218ENST00000550159 GNAI2P04899 355 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-218ENST00000550159 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
CS-218ENST00000550159 CCDC93Q567U6 631 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-218ENST00000550159 TAF7LQ5H9L4 462 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-218ENST00000550159 BEND3Q5T5X7 828 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-218ENST00000550159 CIAPIN1Q6FI81 312 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-218ENST00000550159 PRR5LQ6MZQ0 368 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-218ENST00000550159 NLRP10Q86W26 655 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-218ENST00000550159 ZNF34Q8IZ26 560 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-218ENST00000550159 GPC2Q8N158 579 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-218ENST00000550159 TMEM57Q8N5G2 664 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-218ENST00000550159 ISCA1Q9BUE6 129 aa12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129 ms