RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523334.1

HDAC2-215, Transcript of histone deacetylase 2, human

TSL 2

Gene HDAC2, Length 4,810 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC2-215	ENST00000523334	SLC5A1	P13866	664 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	PDE8A	O60658	829 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	SIK1	P57059	783 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	FBXO3	Q9UK99	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	ITGA6	P23229	1130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	STK3	Q13188	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	UTY	O14607	1347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	MRE11	P49959	708 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	AK2	P54819	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	PLCB2	Q00722	1185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	AIDA	Q96BJ3	306 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	FIBP	O43427	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	XAGE2	Q96GT9	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	USP21	Q9UK80	565 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334		A0A0D9SFI3	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CIAO1	O76071	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CTSW	P56202	376 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	KIF2C	Q99661	725 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	HAUS7	Q99871	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CPA1	P15085	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	PTH1R	Q03431	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	SETDB2	Q96T68	719 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	ERICH2	A1L162	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	SLC27A2	O14975	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	STX6	O43752	255 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC2-215	ENST00000523334	AK7	Q96M32	723 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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