RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 CARNS1A5YM72 827 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 TMF1P82094 1093 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 KNDC1Q76NI1 1749 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 SLAIN2Q9P270 581 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 ADH1AP07327 375 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 SEC13P55735 322 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 GNRH1P01148 92 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 HPS1Q92902 700 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 PANK3Q9H999 370 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 EVC2Q86UK5 1308 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM94Q12767 1356 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 SFI1A8K8P3 1242 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 PSME1Q06323 249 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 CBLBQ13191 982 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF358Q9NW07 568 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 CABP1Q9NZU7 370 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 ATP7BP35670 1465 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-212ENST00000491266 BRD1O95696 1058 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 AVPP01185 164 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 INHAP05111 366 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 GDF10P55107 478 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 MEIOBQ8N635 442 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 ADGRB2O60241 1585 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 USP32Q8NFA0 1604 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 EPHA4P54764 986 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 MYOM1P52179 1685 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 IL2RAP01589 272 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 PTGIRP43119 386 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC184Q52MB2 194 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 XAGE2Q96GT9 111 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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RABGGTB-212ENST00000491266 OCLNQ16625 522 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 TMC1Q8TDI8 760 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 ORAI2Q96SN7 254 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A1W2PP64 1363 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 BACH1O14867 736 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 WEE1P30291 646 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 FOXK2Q01167 660 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 SSH2Q76I76 1423 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 MST1RQ04912 1400 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.41□□□□□ -1.06
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RABGGTB-212ENST00000491266 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 ACEP12821 1306 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 KCNA1Q09470 495 aa8.4□□□□□ -1.06
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