RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COL15A1P39059 1388 aa20.79■□□□□ 0.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 H7C1W4 665 aa20.79■□□□□ 0.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 REC8O95072 547 aa20.79■□□□□ 0.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.79■□□□□ 0.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.78■□□□□ 0.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RAB11FIP3O75154 756 aa20.78■□□□□ 0.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCNQ4P56696 695 aa20.78■□□□□ 0.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.78■□□□□ 0.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAP7D2Q96T17 732 aa20.78■□□□□ 0.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AK9Q5TCS8 1911 aa20.76■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.76■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LY75O60449 1722 aa20.76■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.76■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.76■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.76■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.75■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.75■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.75■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ERC2O15083 957 aa20.74■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GPTP24298 496 aa20.74■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.74■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MBD3O95983 291 aa20.73■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.73■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.73■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FOXO4P98177 505 aa20.73■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.73■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.72■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NLRP10Q86W26 655 aa20.72■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.72■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.72■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.72■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MCM2P49736 904 aa20.72■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.72■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.72■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.71■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PDE1AP54750 535 aa20.7■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.91
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CAMTA2O94983 1202 aa20.7■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.7■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM89AQ96GI7 184 aa20.7■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SIL1Q9H173 461 aa20.7■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BCORQ6W2J9 1755 aa20.7■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MX1P20591 662 aa20.69■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BRD1O95696 1058 aa20.69■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.69■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.69■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.69■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SYCE3A1L190 88 aa20.68■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CUL4AQ13619 759 aa20.68■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COPRSQ9NQ92 184 aa20.68■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.68■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMX3Q96JJ7 454 aa20.68■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DYNC1I1O14576 645 aa20.67■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.67■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SYNE4Q8N205 404 aa20.66■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.66■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SASH1O94885 1247 aa20.66■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRIM37O94972 964 aa20.66■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UQCRHP07919 91 aa20.66■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STAP2Q9UGK3 403 aa20.66■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.66■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.66■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IL17RAQ96F46 866 aa20.65■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.65■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MYH3P11055 1940 aa20.65■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C4BP0C0L5 1744 aa20.65■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GNPATO15228 680 aa20.65■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SMIM5Q71RC9 77 aa20.65■□□□□ 0.9
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPS6KA4O75676 772 aa20.64■□□□□ 0.89
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RXRBP28702 533 aa20.64■□□□□ 0.89
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NEK4P51957 841 aa20.64■□□□□ 0.89
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANAPC15P60006 121 aa20.64■□□□□ 0.89
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.64■□□□□ 0.89
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SCN7AQ01118 1682 aa20.64■□□□□ 0.89
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.63■□□□□ 0.89
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.5 ms