RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 ZNF609O15014 1411 aa18.63■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 A0A0G2JLW4 131 aa18.63■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.63■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
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NISCH-202ENST00000420808 SNRKQ9NRH2 765 aa18.62■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.62■□□□□ 0.573e-6■□□□□ 10.6
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NISCH-202ENST00000420808 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.62■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 TNS3Q68CZ2 1445 aa18.62■□□□□ 0.57
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NISCH-202ENST00000420808 FOXO4P98177 505 aa18.61■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
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NISCH-202ENST00000420808 UBE2HP62256 183 aa18.6■□□□□ 0.57
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NISCH-202ENST00000420808 USP25Q9UHP3 1055 aa18.6■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 HIP1O00291 1037 aa18.6■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 PPFIA3O75145 1194 aa18.6■□□□□ 0.57
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NISCH-202ENST00000420808 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.59■□□□□ 0.57
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NISCH-202ENST00000420808 TTC6Q86TZ1 520 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-202ENST00000420808 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
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NISCH-202ENST00000420808 STOX1Q6ZVD7 989 aa18.58■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 DDX11Q96FC9 970 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
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NISCH-202ENST00000420808 PSMA5P28066 241 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 GOLIM4O00461 696 aa18.56■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.56■□□□□ 0.56
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NISCH-202ENST00000420808 FOSBP53539 338 aa18.56■□□□□ 0.56
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NISCH-202ENST00000420808 PRDM11Q9NQV5 511 aa18.56■□□□□ 0.56
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NISCH-202ENST00000420808 LIG1P18858 919 aa18.55■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 RNF20Q5VTR2 975 aa18.55■□□□□ 0.56
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NISCH-202ENST00000420808 OFD1O75665 1012 aa18.54■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 FUCA2Q9BTY2 467 aa18.54■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 PHF14O94880 888 aa18.54■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 HS1BP3Q53T59 392 aa18.54■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 STRN4Q9NRL3 753 aa18.54■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 NEK1Q96PY6 1258 aa18.53■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa18.53■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 TJP1Q07157 1748 aa18.53■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 PLCB2Q00722 1185 aa18.53■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.52■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 CHST3Q7LGC8 479 aa18.52■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 BRF1Q92994 677 aa18.52■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 LAMB4A4D0S4 1761 aa18.52■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 SYNE4Q8N205 404 aa18.52■□□□□ 0.56
NISCH-202ENST00000420808 WDR17Q8IZU2 1322 aa18.52■□□□□ 0.55
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NISCH-202ENST00000420808 KBTBD3Q8NAB2 608 aa18.51■□□□□ 0.55
NISCH-202ENST00000420808 CPDO75976 1380 aa18.51■□□□□ 0.55
NISCH-202ENST00000420808 KCPQ6ZWJ8 1503 aa18.51■□□□□ 0.55
NISCH-202ENST00000420808 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
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NISCH-202ENST00000420808 PAG1Q9NWQ8 432 aa18.51■□□□□ 0.55
NISCH-202ENST00000420808 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.51■□□□□ 0.55
NISCH-202ENST00000420808 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.51■□□□□ 0.55
NISCH-202ENST00000420808 TTLL5Q6EMB2 1281 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-202ENST00000420808 GTF3C6Q969F1 213 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-202ENST00000420808 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-202ENST00000420808 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-202ENST00000420808 NUP188Q5SRE5 1749 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-202ENST00000420808 SCRN1Q12765 414 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-202ENST00000420808 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
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