RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000030117.4

Smu1-201, Transcript of WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smu1, Length 2,418 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ifi35Q9D8C4 286 aa21.1■□□□□ 0.97
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cfap58B2RW38 873 aa21.09■□□□□ 0.97
Smu1-201ENSMUST00000030117 Csrnp1P59054 583 aa21.09■□□□□ 0.97
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa21.09■□□□□ 0.97
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kiaa0753Q6A000 959 aa21.09■□□□□ 0.97
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ubn2Q80WC1 1314 aa21.09■□□□□ 0.97
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nlrp9bQ66X22 1003 aa21.09■□□□□ 0.97
Smu1-201ENSMUST00000030117 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dixdc1Q80Y83 711 aa21.09■□□□□ 0.97
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zfp317Q8C0Q5 607 aa21.09■□□□□ 0.97
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tmem2Q5FWI3 1383 aa21.08■□□□□ 0.97
Smu1-201ENSMUST00000030117 Neurod6P48986 337 aa21.08■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa21.07■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Adora1Q60612 326 aa21.07■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 DbnlQ62418 436 aa21.07■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nek11Q8C0Q4 628 aa21.07■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Osbpl5Q9ER64 874 aa21.07■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Aox4Q3TYQ9 1336 aa21.07■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Irgm2A0A140LIF8 407 aa21.07■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Usp28Q5I043 1051 aa21.07■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccz1Q8C1Y8 480 aa21.07■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tsen34Q8BMZ5 316 aa21.06■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tlcd1Q99JT6 247 aa21.06■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Syt10Q9R0N4 523 aa21.06■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa21.06■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gm10471E9Q1C7 252 aa21.05■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 GpkowQ56A08 488 aa21.05■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa21.05■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pdzd9Q9D9M4 266 aa21.05■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 FosbP13346 338 aa21.05■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hspa2P17156 633 aa21.05■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dync1i1O88485 628 aa21.04■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Lrrfip2Q91WK0 415 aa21.04■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 InsrrQ9WTL4 1300 aa21.04■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ttll7A4Q9F0 912 aa21.04■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 U2af2P26369 475 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zeb2Q9R0G7 1215 aa21.04■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 TrdnE9Q9K5 693 aa21.03■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Limch1Q3UH68 1057 aa21.03■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Vps54Q5SPW0 977 aa21.03■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ddx60E9PZQ1 1711 aa21.03■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fbxl16A2RT62 479 aa21.03■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Iqsec3Q3TES0 1195 aa21.03■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ifit1Q64282 463 aa21.03■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tmem87bQ8BKU8 555 aa21.03■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mtmr3Q8K296 1196 aa21.03■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Card6E9PWH2 1175 aa21.02■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Lmod3E9QA62 571 aa21.02■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dhx38Q80X98 1228 aa21.02■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ubxn4Q8VCH8 506 aa21.02■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa21.02■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa21.02■□□□□ 0.96
Smu1-201ENSMUST00000030117 Clec11aO88200 328 aa21.02■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa21.02■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rassf8Q8CJ96 419 aa21.02■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tmem109Q3UBX0 243 aa21.01■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa21.01■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hook1Q8BIL5 728 aa21.01■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Usp44Q8C2S0 711 aa21.01■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pcdhb15Q91Y04 786 aa21.01■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Q8C5K5 320 aa21■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Wdr17E9Q271 1322 aa21■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gli3Q61602 1583 aa21■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cnnm1Q0GA42 951 aa21■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa21■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sh3bp5Q9Z131 463 aa21■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Simc1E9Q6E9 1354 aa21■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Col15a1O35206 1367 aa21■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Prl7a2O54831 253 aa20.99■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 TrhQ62361 256 aa20.99■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Prkab2Q6PAM0 271 aa20.99■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc112A0AUP1 442 aa20.99■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zscan29E9Q5B4 869 aa20.99■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 NmiO35309 314 aa20.99■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Stx1aO35526 288 aa20.99■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 TefQ9JLC6 301 aa20.99■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Shank2Q80Z38 1476 aa20.99■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zpr1Q62384 459 aa20.98■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ripor2Q80U16 1078 aa20.98■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mb21d2Q8C525 428 aa20.98■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Chmp7Q8R1T1 451 aa20.98■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 TnrQ8BYI9 1358 aa20.98■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Lrrc8aQ80WG5 810 aa20.98■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 LratQ9JI60 231 aa20.98■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 MypnQ5DTJ9 1315 aa20.98■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nfatc2ipO09130 412 aa20.97■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 AppP12023 770 aa20.97■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cnpy2Q9QXT0 182 aa20.97■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ppfia3P60469 1194 aa20.97■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ano10Q8BH79 659 aa20.97■□□□□ 0.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cdca8Q8BHX3 289 aa20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 175 ms