RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383866.1

RNU6-47P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 47, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-47P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-47P-201ENST00000383866 OMGP23515 440 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 GYG1P46976 350 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ESRRGP62508 458 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 RAP1AP62834 184 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ARL6IP1Q15041 203 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ZNF699Q32M78 642 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 LEG1Q6P5S2 330 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 VSIG1Q86XK7 387 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 SIAH3Q8IW03 269 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 STHQ8IWL8 128 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 SMC5Q8IY18 1101 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 P3H4Q92791 437 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 TIMM29Q9BSF4 260 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 KLHL28Q9NXS3 571 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 MIOXQ9UGB7 285 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 CDH7Q9ULB5 785 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 SIGLEC9Q9Y336 463 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 CACNA1GO43497 2377 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 INS-IGF2F8WCM5 200 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 H3BMH7 237 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 UBE2CO00762 179 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 RAD51BO15315 384 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ANGP03950 147 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 HPGDP15428 266 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ZNF250P15622 560 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 SRYQ05066 204 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 SLMAPQ14BN4 828 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 EPC2Q52LR7 807 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 NKAIN2Q5VXU1 208 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 FBXL13Q8NEE6 735 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 BRSK1Q8TDC3 778 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 FAM162AQ96A26 154 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 FCRL1Q96LA6 429 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 DEFB118Q96PH6 123 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 SLF1Q9BQI6 1058 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 HMG20AQ9NP66 347 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 NARFQ9UHQ1 456 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 USP16Q9Y5T5 823 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 A0A1B0GVX0 72 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ZNF98A6NK75 572 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 STK17BO94768 372 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 TMOD1P28289 359 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 GDI2P50395 445 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 GPM6AP51674 278 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 DLX1P56177 255 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ZP4Q12836 540 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 TFDP1Q14186 410 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 SLC5A12Q1EHB4 618 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 PARP6Q2NL67 630 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 PCOTHQ58A44 107 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 MARCH8Q5T0T0 291 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 C11orf71Q6IPW1 123 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 LYPD2Q6UXB3 125 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 P4HA3Q7Z4N8 544 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 CCDC36Q8IYA8 594 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 CD300LFQ8TDQ1 290 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 PANX3Q96QZ0 392 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 GAL3ST1Q99999 423 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 NFKBIZQ9BYH8 718 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 SELENOIQ9C0D9 397 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 TMEM106BQ9NUM4 274 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 UVRAGQ9P2Y5 699 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ANAPC5Q9UJX4 755 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 V9GY05 133 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 NACADO15069 1562 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 PLAC8L1A1L4L8 177 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 PRSS37A4D1T9 235 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 C3orf84H3BNL1 204 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 PEX7O00628 323 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 CCNE2O96020 404 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ADRB2P07550 413 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 POU2F1P14859 743 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 DCKP27707 260 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 FMO3P31513 532 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 KCNJ1P48048 391 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 KLK7P49862 253 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-47P-201ENST00000383866 RAD23AP54725 363 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms