RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586397.5

PRKAR1A-211, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 1,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-211ENST00000586397 OTX2P32243 289 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 RBM34P42696 430 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC6A8P48029 635 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 TUBA4AP68366 448 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 RPP38P78345 283 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 RAPSNQ13702 412 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 APOFQ13790 326 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 INAQ16352 499 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 BCL2A1Q16548 175 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 NADK2Q4G0N4 442 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 DESI1Q6ICB0 168 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 ULK3Q6PHR2 472 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 MISPQ8IVT2 679 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 GRHL3Q8TE85 626 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 TTC9Q92623 222 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 HGDQ93099 445 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMCO6Q96DC7 493 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 LAT2Q9GZY6 243 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF160Q9HCG1 818 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 SELENONQ9NZV5 590 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.09□□□□□ -1.11
PRKAR1A-211ENST00000586397 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR2J2O76002 312 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR6B1O95007 311 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 ANGPTL1O95841 491 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 FBXO45P0C2W1 286 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 CHMP24386 653 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 FPR3P25089 353 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 GGT2P36268 569 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 OMPP47874 163 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 GSSP48637 474 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 CCR4P51679 360 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 CRISP1P54107 249 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 FBXW4P57775 412 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF117Q03924 483 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 TSPAN31Q12999 210 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 KCTD21Q4G0X4 260 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 LYPD8Q6UX82 237 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 NUP54Q7Z3B4 507 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 MARCH3Q86UD3 253 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 NRMQ8IXM6 262 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF786Q8N393 782 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 CADM2Q8N3J6 435 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 RNF138Q8WVD3 245 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM239Q8WW34 195 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 ARSGQ96EG1 525 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 HS6ST2Q96MM7 605 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 RASL10BQ96S79 203 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF426Q9BUY5 554 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 FBXL4Q9UKA2 621 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.08□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZAR1LA6NP61 321 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC30A4O14863 429 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 KLF4O43474 513 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 OIP5O43482 229 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 HCRTR2O43614 444 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 SCO2O43819 266 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 ITGA10O75578 1167 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 CELA2AP08217 269 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 NAT1P18440 290 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 TTKP33981 857 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 ISL1P61371 349 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 IL5RAQ01344 420 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 CD47Q08722 323 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 IL10RAQ13651 578 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 NTRK2Q16620 822 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 NDUFA5Q16718 116 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 CBLN3Q6UW01 205 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 MRGPREQ86SM8 312 aa8.07□□□□□ -1.12
PRKAR1A-211ENST00000586397 RAB43Q86YS6 212 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms