RNA–Protein interactions for RNA: YOR179C

SYC1, Transcript of Subunit of the APT subcomplex of cleavage and polyadenylation factor, yeast

Gene SYC1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYC1	YOR179C	ENA2	Q01896	1091 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	SIZ1	Q04195	904 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	BRE4	Q07660	1125 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	ENA5	Q12691	1091 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	ZRG8	P40021	1076 aa		5	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
SYC1	YOR179C	YGR012W	P53206	393 aa		5	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	ORC3	P54790	616 aa		5	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	VPS30	Q02948	557 aa		5	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	THI73	Q07904	523 aa		5	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	HSF1	P10961	833 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	YCL002C	P25565	263 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	STE13	P33894	931 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	MCD4	P36051	919 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	CAF16	P43569	289 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	PMT3	P47190	753 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	CDA1	Q06702	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	GAL10	P04397	699 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	SFL1	P20134	766 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	PCL2	P25693	308 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	RPD3	P32561	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	SAP190	P36123	1033 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	ALY2	P47029	1046 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	YGR237C	P50089	785 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	HDA1	P53973	706 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
SYC1	YOR179C	ELM1	P32801	640 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	YEL1	P34225	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	SHR5	P41912	237 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	PUS2	P53167	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	UME1	Q03010	460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYC1	YOR179C	DIF1	O13577	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	PRC1	P00729	532 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	HOG1	P32485	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	TOM20	P35180	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	MGS1	P40151	587 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	MET13	P53128	600 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	ROT1	Q03691	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	MND2	P40577	368 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	HXT16	P47185	567 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	AIM14	P53109	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	CRR1	Q05790	422 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	GUD1	Q07729	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	SPE1	P08432	466 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	HMG1	P12683	1054 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	POA1	P38218	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	SNO2	P53823	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	NHX1	Q04121	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	COG8	Q04632	607 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	SGD1	Q06132	899 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	ATG33	Q06485	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	GUP2	Q08929	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	GCV2	P49095	1034 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	GPG1	P53130	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	PLB2	Q03674	706 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	TPO1	Q07824	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	DFG16	Q99234	619 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	YJR096W	P47137	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	RNQ1	P25367	405 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	LRG1	P35688	1017 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	HSL7	P38274	827 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	LAM1	P38851	1228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	YFL052W	P43551	465 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	NPY1	P53164	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	MRPL22	P53881	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	HFD1	Q04458	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYC1	YOR179C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.1 ms