RNA–Protein interactions for RNA: YML094W

GIM5, Transcript of Subunit of the heterohexameric cochaperone prefoldin complex, yeast

Gene GIM5, Length 492 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GIM5	YML094W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	TIM23	P32897	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	AFR1	P33304	620 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	YRO2	P38079	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	AIM21	P40563	679 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	RNH70	P53331	553 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	PPM2	Q08282	695 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	CAN1	P04817	590 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	NPP1	P25353	742 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	STE13	P33894	931 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	BET3	P36149	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	RPN4	Q03465	531 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	SED4	P25365	1065 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	REC104	P33323	182 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	NUP82	P40368	713 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	PHO23	P50947	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	UPC2	Q12151	913 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
GIM5	YML094W	TAF8	Q03750	510 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	TOK1	P40310	691 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	AIM39	Q08223	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GIM5	YML094W	FBP1	P09201	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	KAR4	P25583	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	STE14	P32584	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	PPG1	P32838	368 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	PET10	P36139	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	MSS4	P38994	779 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	HUL4	P40985	892 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	RIP-Chip
GIM5	YML094W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	CHS7	P38843	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	SUN4	P53616	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	CTF4	Q01454	927 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	KTR4	P38131	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	CTF8	P38877	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	SDP1	P40479	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	NIT3	P49954	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	GAL11	P19659	1081 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	ALG12	P53730	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	KIN4	Q01919	800 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	PHO8	P11491	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	ENV7	Q12003	364 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	LAS17	Q12446	633 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
GIM5	YML094W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	THI4	P32318	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	BUL1	P48524	976 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	SLI1	P53304	468 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	HDA1	P53973	706 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIM5	YML094W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	EMC3	P36039	253 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	GDH3	P39708	457 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	CEP3	P40969	608 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	MAL11	P53048	616 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	PUS2	P53167	370 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	DAM1	P53267	343 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	PEX19	Q07418	342 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	SWM1	Q12379	170 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	TRM11	Q12463	433 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	YHR078W	P38799	552 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	REH1	Q06709	432 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	RAD53	P22216	821 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	ERG4	P25340	473 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	RPD3	P32561	433 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	CTF13	P35203	478 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	OAR1	P35731	278 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	GYP8	P43570	497 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	OSW7	P43611	510 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	RNT1	Q02555	471 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	OMS1	Q06668	471 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	NGG1	P32494	702 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	ALG2	P43636	503 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GIM5	YML094W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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