RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W CIT2P08679 460 aa6.48□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W GRX1P25373 110 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W MSE1P48525 536 aa6.48□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W PUS9Q12069 462 aa6.48□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W NPC2Q12408 173 aa6.48□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W KCS1Q12494 1050 aa6.48□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W NPP1P25353 742 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W PFD1P46988 109 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W YJL049WP47048 450 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W NCS6P53088 359 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W LCD1Q04377 747 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W FMP25Q08023 583 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W ENB1Q08299 606 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W GUP2Q08929 609 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W YOR131CQ12486 218 aa6.47□□□□□ -1.37
YKR104WYKR104W NOT3P06102 836 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W SSB1P11484 613 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W HBS1P32769 611 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W SSB2P40150 613 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W PHO23P50947 330 aa6.46□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W ERP6P53198 216 aa6.46□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W UTP8P53276 713 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W PFK1P16861 987 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W AFR1P33304 620 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W DEF1P35732 738 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W AIM21P40563 679 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W ALR2P43553 858 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W NSE3Q05541 303 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W UPC2Q12151 913 aa6.44□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W OSH2Q12451 1283 aa6.44□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W YGR161W-CQ3E744 92 aa6.44□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W ATG2P53855 1592 aa6.44□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data6.43□□□□□ -1.38not detected
YKR104WYKR104W SED4P25365 1065 aa6.43□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W REC104P33323 182 aa6.43□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W STE13P33894 931 aa6.43□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W EAF1Q06337 982 aa6.43□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W AIM39Q08223 395 aa6.43□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W RFA1P22336 621 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W RPN4Q03465 531 aa6.42□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W REV3P14284 1504 aa6.41□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data6.41□□□□□ -1.38not detected
YKR104WYKR104W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data6.41□□□□□ -1.38not detected
YKR104WYKR104W TOK1P40310 691 aa6.41□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W SUN4P53616 420 aa6.41□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W KAR4P25583 335 aa6.4□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W ARE1P25628 610 aa6.4□□□□□ -1.38
YKR104WYKR104W RAD4P14736 754 aa6.39□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W HSP60P19882 572 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W HRR25P29295 494 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W MSS4P38994 779 aa6.39□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W YGL081WP53156 320 aa6.39□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W YPR071WQ12346 211 aa6.39□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W MET6P05694 767 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W CAD1P24813 409 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W STE14P32584 239 aa6.38□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W PET10P36139 283 aa6.38□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W MNN1P39106 762 aa6.38□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W TPM2P40414 161 aa6.38□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data6.38□□□□□ -1.39not detected
YKR104WYKR104W HBN1Q96VH4 193 aa6.38□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W FBP1P09201 348 aa6.37□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W YBR284WP38150 797 aa6.37□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W CTF4Q01454 927 aa6.37□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W BDF2Q07442 638 aa6.37□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W YOL057WQ08225 711 aa6.37□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W MPH2P0CD99 609 aa6.36□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W GRX4P32642 244 aa6.36□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W SDP1P40479 209 aa6.36□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W HUL4P40985 892 aa6.36□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W NOP2P40991 618 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W TIM54P47045 478 aa6.36□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W YJR142WP47173 342 aa6.36□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data6.36□□□□□ -1.39not detected
YKR104WYKR104W KIN4Q01919 800 aa6.36□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W YKR011CQ02209 353 aa6.36□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W CIT1P00890 479 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W MSD1P15179 658 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W URA1P28272 314 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W EFT1P32324 842 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W ERT1P38140 529 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W CHS7P38843 316 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W BUD6P41697 788 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W NIT3P49954 291 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W YGR125WP53273 1036 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W GIN4Q12263 1142 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W CTF8P38877 133 aa6.34□□□□□ -1.39
YKR104WYKR104W CEP3P40969 608 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.5 ms