RNA–Protein interactions for RNA: YJL025W

RRN7, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN7, Length 1,545 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN7	YJL025W	MXR1	P40029	184 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	MSE1	P48525	536 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	VPS16	Q03308	798 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	SLA2	P33338	968 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	YAP3	P38749	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	BUD6	P41697	788 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	NTO1	Q12311	748 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	BI4	P03879	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	EMC1	P25574	760 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	PNT1	P38969	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	LYP1	P32487	611 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	PEP7	P32609	515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	MND2	P40577	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	HFM1	P51979	1187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	MAK10	Q02197	733 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
RRN7	YJL025W	MNN1	P39106	762 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	SUN4	P53616	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	BNR1	P40450	1375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	DCG1	P32460	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	DUT1	P33317	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	AIM21	P40563	679 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	GCV2	P49095	1034 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	ADY3	Q07732	790 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	MNR2	P35724	969 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	BDF2	Q07442	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	TPO1	Q07824	586 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	KAR1	P11927	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	DPB3	P27344	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	GRX7	P38068	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	MET12	P46151	657 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	PHO23	P50947	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	SLI1	P53304	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
RRN7	YJL025W	RKM4	Q12504	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN7	YJL025W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	CDC34	P14682	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	POA1	P38218	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	PLB1	P39105	664 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	UBP12	P39538	1254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	YJR142W	P47173	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	MTC3	P53077	123 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	EEB1	Q02891	456 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	HIS5	P07172	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	CHS7	P38843	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	XYL2	Q07993	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	INO1	P11986	533 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
RRN7	YJL025W	MRC1	P25588	1096 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	PET112	P33893	541 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	TYW3	P53177	273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	CWC24	P53769	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	CTF4	Q01454	927 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	ENA1	P13587	1091 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	GAL11	P19659	1081 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	YKL107W	P34251	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	YAP1801	P38856	637 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	NUP82	P40368	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	CHA4	P43634	648 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	OSW2	Q12202	724 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	SEC6	P32844	805 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN7	YJL025W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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