RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data4.48□□□□□ -1.69not detected
SPC105YGL093W MRPL10P36520 322 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W FOL2P51601 243 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W YDL057WQ07379 328 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W GIS3Q12418 502 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W CLC1P17891 233 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W GLN3P18494 730 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W SPO11P23179 398 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W MRC1P25588 1096 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W TRM2P33753 639 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W LAM5P43560 674 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W ALT2P52892 507 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data4.48□□□□□ -1.69not detected
SPC105YGL093W PIB1Q06651 286 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W CDC37P06101 506 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data4.48□□□□□ -1.69not detected
SPC105YGL093W CYS3P31373 394 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W KTR2P33550 425 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W YHR054CP38780 354 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W FYV8P46949 817 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W EBS1Q03466 884 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W ERV41Q04651 352 aa4.48□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W LEO1P38439 464 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W MMF1P40185 145 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W LCB2P40970 561 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W RSC8P43609 557 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W TOS3P43637 560 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W ACF4P47129 309 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W RSC1P53236 928 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W ESBP6P53918 673 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W TIM8P57744 87 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W VPS72Q03388 795 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W YAP7Q08182 245 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W MSD1P15179 658 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W COX11P19516 300 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W MUD1P32605 298 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W PXL1P36166 706 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W ESL1P40456 1118 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W SGM1P47166 707 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W ASN1P49089 572 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W WAR1Q03631 944 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W TRS130Q03660 1102 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W AFT2Q08957 416 aa4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SPC105YGL093W PHO13P19881 312 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W AVT1P47082 602 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W GCV2P49095 1034 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W MUK1Q02866 612 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W YLR297WQ05899 129 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W APC5Q08683 685 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W CHS2P14180 963 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W DAL7P21826 554 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W SCJ1P25303 377 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W VPH1P32563 840 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W MIC60P36112 540 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W SLX1P38324 304 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W YHL026CP38740 315 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W TVP23P38962 199 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W HXT8P40886 569 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W VPS75P53853 264 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W CTR9P89105 1077 aa4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W RPS3P05750 240 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W IDI1P15496 288 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W TRK2P28584 889 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data4.45□□□□□ -1.7not detected
SPC105YGL093W VID24P38263 362 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W UBX7P38349 436 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W MIP6P38760 659 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W UBP5P39944 805 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W MLH2Q07980 695 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W CIR2Q08822 631 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W KIP1P28742 1111 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W PSO2P30620 661 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W SWI3P32591 825 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W YEL1P34225 687 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W YET1P35723 206 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W YHR202WP38887 602 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W JHD1P40034 492 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W YER186CP40101 306 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W ALG11P53954 548 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W YLR455WQ06188 304 aa4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W CSR1Q06705 408 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W HAP2P06774 265 aa4.44□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W SNF1P06782 633 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W SEC21P32074 935 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W RAD54P32863 898 aa4.44□□□□□ -1.7
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