RNA–Protein interactions for RNA: YDR138W

HPR1, Transcript of Subunit of THO/TREX complexes, yeast

Gene HPR1, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HPR1	YDR138W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	NHX1	Q04121	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	COG8	Q04632	607 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	LAP2	Q10740	671 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	ELG1	Q12050	791 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	ROG3	P43602	733 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	RET2	P43621	546 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	HFI1	Q12060	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	DCS2	Q12123	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	SSH4	P32343	579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	MCM10	P32354	571 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	OAF3	P36023	863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YKL133C	P36066	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YKR051W	P36142	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	UBA2	P52488	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	SRT1	Q03175	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	DID4	P36108	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	SAP185	P40856	1058 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	ARP4	P80428	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	EAR1	Q03212	550 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	XYL2	Q07993	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	BEM3	P32873	1128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	SKY1	Q03656	742 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	APM4	Q99186	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	DAL7	P21826	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	RIM4	P38741	713 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YAP1801	P38856	637 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	REH1	Q06709	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YKU70	P32807	602 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	ATG14	P38270	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	TDA3	P38758	523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YER158C	P40095	573 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	HDA1	P53973	706 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YSC84	P32793	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	PEX15	Q08215	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	ENA1	P13587	1091 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	CDC26	P14724	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	NDE1	P40215	560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	MEP3	P53390	489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	VPS30	Q02948	557 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	PSR2	Q07949	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
HPR1	YDR138W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	PTH2	P34222	208 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	MAL31	P38156	614 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	EAF5	P39995	279 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	MNT3	P40549	630 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	ALY2	P47029	1046 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SLD3	P53135	668 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SCW11	P53189	542 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	OMS1	Q06668	471 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SLP1	Q12232	587 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	ACE2	P21192	770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	HSL7	P38274	827 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	BRE2	P43132	505 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	GTR1	Q00582	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	ERP4	Q12450	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	HOP1	P20050	605 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	GPT2	P36148	743 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	HFM1	P51979	1187 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	CAF120	P53836	1060 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HPR1	YDR138W	YHM2	Q04013	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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