RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W ISM1P48526 1002 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W STB4P50104 949 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W COG2P53271 262 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YNL108CP53929 270 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W CIK1Q01649 594 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W FIN1Q03898 291 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YPQ2Q06328 317 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W IES3Q12345 250 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-HO13535 1793 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-JR1P47098 1755 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-ER1Q03612 1755 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-GR2Q12269 1755 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-OLQ12273 1755 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W KSS1P14681 368 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W OSM1P21375 501 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W AFG2P32794 780 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W CDC27P38042 758 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W DYS1P38791 387 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W HAL5P38970 855 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W XKS1P42826 600 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RET2P43621 546 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W BSC5P53755 489 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ATG13Q06628 738 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MCM21Q06675 368 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W LOT6Q07923 191 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SDH5Q08230 162 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ICL2Q12031 575 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SCM3Q12334 223 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YBL113CQ7M4S9 792 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ADE8P04161 214 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W CKA2P19454 339 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PHO3P24031 467 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W KES1P35844 434 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RTG3P38165 486 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W CTM1P38818 585 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W CNN1P43618 361 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W GCV2P49095 1034 aa5.44□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W GAL1P04385 528 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PDB1P32473 366 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W HSE1P38753 452 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W EDC3P39998 551 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W BUD6P41697 788 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W INA17Q02888 182 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W BBP1Q12365 385 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W CAT8P39113 1433 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MSS116P15424 664 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W THR1P17423 357 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W DAP2P18962 818 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data5.43□□□□□ -1.54not detected
CYK3YDL117W APL1P27351 700 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YME1P32795 747 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W DBP7P36120 742 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MSR1P38714 643 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YHI9P38765 294 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RPN10P38886 268 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W CCT3P39077 534 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PCI8P40512 444 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YML083CQ04526 418 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data5.43□□□□□ -1.54not detected
CYK3YDL117W PAN1P32521 1480 aa5.43□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RAM2P29703 316 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W GDA1P32621 518 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TDA11P38854 504 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YER137CP40083 148 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SEC28P40509 296 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W BNA6P43619 295 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W STB2P46679 850 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W COG6P53959 839 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W VPS16Q03308 798 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YLR352WQ06479 807 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ALG1P16661 449 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SFL1P20134 766 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W VPS3P23643 1011 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MRPL32P25348 183 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ASF2P32448 525 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RPT1P33299 467 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W CPR5P35176 225 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W TEF4P36008 412 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W STP2P38704 541 aa5.42□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YER186CP40101 306 aa5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 52.8 ms