RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CPR4	YCR069W	RMD1	Q03441	430 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CPR4	YCR069W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CPR4	YCR069W	RTT10	Q08924	1013 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CPR4	YCR069W	YPL277C	Q08989	487 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CPR4	YCR069W	SOD2	P00447	233 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	MPH1	P40562	993 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	YDR306C	Q06640	478 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	BUG1	Q12191	341 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	DAL5	P15365	543 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	YCR015C	P25616	317 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	YKL222C	P35995	705 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	TAF1	P46677	1066 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	ALE1	Q08548	619 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	MRP7	P12687	371 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	TOD6	P34219	525 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	UGA2	P38067	497 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	FLR1	P38124	548 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	MCM7	P38132	845 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	HNT2	P49775	206 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	YOR352W	Q08816	343 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	NPR2	P39923	615 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	SGD1	Q06132	899 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	SAC3	P46674	1301 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	DUT1	P33317	147 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	PET112	P33893	541 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	GIP4	P39732	760 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	RFC5	P38251	354 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	LAM1	P38851	1228 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	YDR132C	Q03900	495 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	RSM24	Q03976	319 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	CSI1	Q04368	295 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	GNT1	Q12096	491 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	SWI1	P09547	1314 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CPR4	YCR069W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	CDC34	P14682	295 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	BAS1	P22035	811 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	LYP1	P32487	611 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	NUP133	P36161	1157 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	MEF2	P39677	819 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.46	□□□□□ -1.54	not detected
CPR4	YCR069W	SVS1	Q12254	260 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	NYV1	Q12255	253 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	UBP12	P39538	1254 aa		5.45	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	MXR1	P40029	184 aa		5.45	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	SPT20	P50875	604 aa		5.45	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	EEB1	Q02891	456 aa		5.45	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	GCN5	Q03330	439 aa		5.45	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	ROT1	Q03691	256 aa		5.45	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	NCB2	Q92317	146 aa		5.45	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	GAL10	P04397	699 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	CMP2	P14747	604 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	SRM1	P21827	482 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	PKH1	Q03407	766 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	PLB2	Q03674	706 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	VPS64	Q03944	604 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	RAD50	P12753	1312 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	CDC16	P09798	840 aa		5.43	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.43	□□□□□ -1.54	not detected
CPR4	YCR069W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	APL1	P27351	700 aa		5.43	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	RAD24	P32641	659 aa		5.43	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	MNR2	P35724	969 aa		5.43	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	TYW3	P53177	273 aa		5.43	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	SPO1	P53541	631 aa		5.43	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	ACM1	Q08981	209 aa		5.43	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	YLR358C	O13565	187 aa		5.42	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	INO1	P11986	533 aa		5.42	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	UBX2	Q04228	584 aa		5.42	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	BI4	P03879	638 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	PIF1	P07271	859 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	SLA2	P33338	968 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	PFF1	P38244	976 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	PNT1	P38969	423 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	GEM1	P39722	662 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	YGL082W	P53155	381 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CPR4	YCR069W	ZDS2	P54786	942 aa		5.41	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.8 ms