RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CHMLP26374 656 aa27.85■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 VPS72Q15906 364 aa27.85■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.84■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 REC8O95072 547 aa27.83■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.83■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.83■■■□□ 2.05
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
VSTM4-201ENST00000298454 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.82■■■□□ 2.04
VSTM4-201ENST00000298454 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
VSTM4-201ENST00000298454 HLFQ16534 295 aa27.82■■■□□ 2.04
VSTM4-201ENST00000298454 CERKQ8TCT0 537 aa27.81■■■□□ 2.04
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VSTM4-201ENST00000298454 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
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VSTM4-201ENST00000298454 HSCBQ8IWL3 235 aa27.8■■■□□ 2.04
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VSTM4-201ENST00000298454 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.77■■■□□ 2.04
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VSTM4-201ENST00000298454 SIK1P57059 783 aa27.77■■■□□ 2.04
VSTM4-201ENST00000298454 USP21Q9UK80 565 aa27.77■■■□□ 2.04
VSTM4-201ENST00000298454 TFCP2Q12800 502 aa27.77■■■□□ 2.04
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VSTM4-201ENST00000298454 IL25Q9H293 177 aa27.76■■■□□ 2.03
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.76■■■□□ 2.03
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VSTM4-201ENST00000298454 MYT1Q01538 1121 aa27.75■■■□□ 2.03
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VSTM4-201ENST00000298454 ITPK1Q13572 414 aa27.75■■■□□ 2.03
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VSTM4-201ENST00000298454 ANTXR1Q9H6X2 564 aa27.74■■■□□ 2.03
VSTM4-201ENST00000298454 TNNI3KQ59H18 835 aa27.73■■■□□ 2.03
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
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VSTM4-201ENST00000298454 NLRP10Q86W26 655 aa27.73■■■□□ 2.03
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VSTM4-201ENST00000298454 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.73■■■□□ 2.03
VSTM4-201ENST00000298454 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.72■■■□□ 2.03
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VSTM4-201ENST00000298454 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
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VSTM4-201ENST00000298454 BOLA2Q9H3K6 86 aa27.69■■■□□ 2.02
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VSTM4-201ENST00000298454 EVI5LQ96CN4 794 aa27.68■■■□□ 2.02
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
VSTM4-201ENST00000298454 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.68■■■□□ 2.02
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VSTM4-201ENST00000298454 EYA2O00167 538 aa27.66■■■□□ 2.02
VSTM4-201ENST00000298454 NFKBIBQ15653 356 aa27.66■■■□□ 2.02
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.66■■■□□ 2.02
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VSTM4-201ENST00000298454 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.66■■■□□ 2.02
VSTM4-201ENST00000298454 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.65■■■□□ 2.02
VSTM4-201ENST00000298454 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
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VSTM4-201ENST00000298454 ATP5JP18859 108 aa27.62■■■□□ 2.01
VSTM4-201ENST00000298454 MCCP23508 829 aa27.62■■■□□ 2.01
VSTM4-201ENST00000298454 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.62■■■□□ 2.01
VSTM4-201ENST00000298454 KCNQ4P56696 695 aa27.62■■■□□ 2.01
VSTM4-201ENST00000298454 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
VSTM4-201ENST00000298454 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
VSTM4-201ENST00000298454 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
VSTM4-201ENST00000298454 AFF2P51816 1311 aa27.61■■■□□ 2.01
VSTM4-201ENST00000298454 CAMTA2O94983 1202 aa27.6■■■□□ 2.01
VSTM4-201ENST00000298454 TIMM10P62072 90 aa27.6■■■□□ 2.01
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