RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 SSFA2P28290 1259 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 MCM5P33992 734 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 SPA17Q15506 151 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 CABP5Q9NP86 173 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 PIK3C2GO75747 1445 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 ANXA1P04083 346 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 MPNDQ8N594 471 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 H0YHG0 523 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 CETN2P41208 172 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 VPS36Q86VN1 386 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 FBLN1P23142 703 aa21.95■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 AMPD3Q01432 767 aa21.95■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.95■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 KRT23Q9C075 422 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC66A2RUB6 948 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 ATP2B3Q16720 1220 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 FSIP1Q8NA03 581 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 ANAPC15P60006 121 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 TMTC2Q8N394 836 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 NEFHP12036 1026 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 LINS1Q8NG48 757 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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PTPRE-201ENST00000254667 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 PDE1AP54750 535 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 CAVIN2O95810 425 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 CALML4Q96GE6 196 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 SETDB2Q96T68 719 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 ATP6V1AP38606 617 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 MAP3K5Q99683 1374 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 SDSP20132 328 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 SKAP1Q86WV1 359 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 NLRP3Q96P20 1036 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 DDB1Q16531 1140 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 TESK2Q96S53 571 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 TRAF1Q13077 416 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 TBX22Q9Y458 520 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 NEMFO60524 1076 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 MICU3Q86XE3 530 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRE-201ENST00000254667 GBP3Q9H0R5 595 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 ABCC2Q92887 1545 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 BMP15O95972 392 aa21.9■■□□□ 1.1
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PTPRE-201ENST00000254667 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRE-201ENST00000254667 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.9■■□□□ 1.1
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PTPRE-201ENST00000254667 PTPN14Q15678 1187 aa21.89■■□□□ 1.1
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PTPRE-201ENST00000254667 KIF5CO60282 957 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 UBE2HP62256 183 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
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PTPRE-201ENST00000254667 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 SCLT1Q96NL6 688 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 CYP7A1P22680 504 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 UBA7P41226 1012 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 GSDMDP57764 484 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 GNAQP50148 359 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 CETN1Q12798 172 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 TSPYL1Q9H0U9 437 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 YEATS4O95619 227 aa21.87■■□□□ 1.09
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