RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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PANX1-201ENST00000227638 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PANX1-201ENST00000227638 CHST3Q7LGC8 479 aa21.63■■□□□ 1.05
PANX1-201ENST00000227638 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
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PANX1-201ENST00000227638 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.62■■□□□ 1.05
PANX1-201ENST00000227638 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
PANX1-201ENST00000227638 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.62■■□□□ 1.05
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