RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047993.9

Hoxa13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Hoxa13, Length 1,309 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ddx58Q6Q899 926 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccdc60Q8C4J0 545 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Anks4bQ8K3X6 423 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rbm46P86049 533 aa32.48■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gja10Q9WUS4 505 aa32.48■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Disp3A3KFU9 1347 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm7347D3YYI9 267 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Speer4aF8VPX6 267 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cyp19a1P28649 503 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Foxo4Q9WVH3 505 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Myh1Q5SX40 1942 aa32.46■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Col5a2Q3U962 1497 aa32.45■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cops6O88545 324 aa32.45■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cyp7a1Q64505 503 aa32.45■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ppm1mQ8BU27 406 aa32.45■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cwc25Q9DBF7 416 aa32.45■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Soga3Q6NZL0 945 aa32.44■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 NpcdF8VQB8 469 aa32.43■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 NmiO35309 314 aa32.43■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Csf1rP09581 977 aa32.42■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Psd3Q2PFD7 1037 aa32.42■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 BcanQ61361 883 aa32.42■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Nectin2P32507 530 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Clca2Q8BG22 942 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Stard3nlQ9DCI3 235 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 EappQ5BU09 281 aa32.4■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kank1E9Q238 1360 aa32.39■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ttc19Q8CC21 365 aa32.39■■■□□ 2.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Nup188Q6ZQH8 1759 aa32.38■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Setdb1O88974 1307 aa32.38■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Aifm3Q3TY86 605 aa32.38■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tmco5bQ80X59 307 aa32.38■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa32.38■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Flt1P35969 1333 aa32.37■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 WaslQ91YD9 501 aa32.37■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ehd4Q9EQP2 541 aa32.37■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cyp2ab1S4R196 498 aa32.37■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 PnnO35691 725 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gpr101Q80T62 511 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fam213aQ9CYH2 218 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ttc41Q692V3 1318 aa32.35■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa32.34■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Chrna5Q2MKA5 467 aa32.32■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Insm1Q63ZV0 521 aa32.32■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa32.32■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Btaf1E9QAE3 1848 aa32.32■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa32.32■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pcsk7Q61139 770 aa32.31■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ppp1r1bQ60829 194 aa32.3■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ripor2Q80U16 1078 aa32.3■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mical3Q8CJ19 1993 aa32.3■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Map3k13Q1HKZ5 959 aa32.29■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 DaglaQ6WQJ1 1044 aa32.29■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Zap70P43404 618 aa32.28■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Usp48Q3V0C5 1052 aa32.28■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ttc14Q9CSP9 761 aa32.28■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ofd1Q80Z25 1017 aa32.27■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa32.27■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Adarb2Q9JI20 745 aa32.27■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa32.27■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Oas2E9Q9A9 742 aa32.26■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Trim34bJ3QNR8 485 aa32.26■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 HellsQ60848 821 aa32.26■■■□□ 2.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Greb1lB9EJV3 1913 aa32.26■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Zbtb38Q3LR78 1197 aa32.26■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 VeztQ3ZK22 780 aa32.26■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Map3k9Q3U1V8 1077 aa32.25■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Vil1Q62468 827 aa32.25■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Bend3Q6PAL0 825 aa32.25■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 PdgfdQ925I7 370 aa32.25■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cdca7Q9D0M2 382 aa32.25■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Popdc2Q9ES82 367 aa32.25■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Dydc2Q9D3X8 139 aa32.24■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 UvssaQ9D479 717 aa32.24■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lgr5Q9Z1P4 907 aa32.24■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 NfixP70257 488 aa32.23■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kif2cQ922S8 721 aa32.23■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Znf609Q8BZ47 1413 aa32.22■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ric3Q8BPM6 367 aa32.21■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Myoz2Q9JJW5 264 aa32.21■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ltn1Q6A009 1767 aa32.2■■■□□ 2.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.74
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 88.2 ms