RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380135.7

LETMD1-202, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene LETMD1, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-202ENST00000380135 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 OMA1Q96E52 524 aa14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 ELP4Q96EB1 424 aa14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 PROK2Q9HC23 129 aa14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 PNPOQ9NVS9 261 aa14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 THAP1Q9NVV9 213 aa14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.77□□□□□ -0.04
LETMD1-202ENST00000380135 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 WIPF3A6NGB9 483 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 UPK1AO00322 258 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 LDLRP01130 860 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 CT45A8P0DMV1 189 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 CT45A9P0DMV2 189 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 CASP6P55212 293 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 PSPHP78330 225 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 HSF1Q00613 529 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 ATG16L1Q676U5 607 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 PAOXQ6QHF9 649 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 SLC34A3Q8N130 599 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 OR2L13Q8N349 312 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 ZFP64Q9NPA5 681 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 ASIC5Q9NY37 505 aa14.77□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 PRPS1L1P21108 318 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 GPC1P35052 558 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 CA7P43166 264 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 CORO7P57737 925 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 HSPB3Q12988 150 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 PTGR1Q14914 329 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 FJX1Q86VR8 437 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 DOHHQ9BU89 302 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 REM1O75628 298 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 PDE9AO76083 593 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 SNX4O95219 450 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 PSMG1O95456 288 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 G6PDP11413 515 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 ABOP16442 354 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 CASP3P42574 277 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 SLC10A1Q14973 349 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 C3AR1Q16581 482 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 CPTPQ5TA50 214 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 TMEM198Q66K66 360 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 NATD1Q8N6N6 113 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 HGDQ93099 445 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 TMBIM1Q969X1 311 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 COL21A1Q96P44 957 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 NUF2Q9BZD4 464 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.75□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 A0A1B0GTH9 108 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 CCL21O00585 134 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 ABCB7O75027 752 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 UGT2B11O75310 529 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 RNF224P0DH78 156 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 LAMP1P11279 417 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 PTGS2P35354 604 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 KRT20P35900 424 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 MAGEA5P43359 124 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 CLDN8P56748 225 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 PSG6Q00889 435 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 MLC1Q15049 377 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 BICRALQ6AI39 1079 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.74□□□□□ -0.05
LETMD1-202ENST00000380135 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms