RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKL151CP36059 337 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGL176CP46945 554 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q UBA2P52488 636 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q SRP1Q02821 542 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q YML122CQ03207 126 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPL066WQ12194 479 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q HRQ1Q05549 1077 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q KAR4P25583 335 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q SRP101P32916 621 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q GIC1P38785 314 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGR053CP53234 283 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q OMS1Q06668 471 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOL073CQ08232 322 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRP4P07285 380 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q SCT1P32784 759 aa3.44□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q MOT2P34909 587 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKR078WP36158 585 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q SAH1P39954 449 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q STU2P46675 888 aa3.44□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q GYP7P48365 746 aa3.44□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q TIM44Q01852 431 aa3.44□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q LAS17Q12446 633 aa3.44□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q NAP1P25293 417 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC12P32468 407 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q QRI1P43123 477 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q BUL1P48524 976 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR040CQ07988 224 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q UPC2Q12151 913 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q ACF2Q12168 779 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERG4P25340 473 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q SUL1P38359 859 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q OYE2Q03558 400 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q MCH5Q08777 521 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q SED4P25365 1065 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q AGP1P25376 633 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q SBA1P28707 216 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q RAI1P53063 387 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q RNT1Q02555 471 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q CAD1P24813 409 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q YBR238CP38330 731 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q YER158CP40095 573 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data3.4□□□□□ -1.87not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q YML020WQ03722 664 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q TMN2Q04562 672 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q PPR1P07272 904 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q CLN2P20438 545 aa3.39□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q STE14P32584 239 aa3.39□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data3.39□□□□□ -1.87not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKE2P52553 114 aa3.39□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q SHE9Q04172 456 aa3.39□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q WHI4Q07655 649 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q IRC10Q08118 586 aa3.39□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC48P25694 835 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q NPP2P39997 493 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATF1P40353 525 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q SFB2P53953 876 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS30Q02948 557 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q ALG7P07286 448 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q FBP1P09201 348 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q TSL1P38427 1098 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q STB4P50104 949 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS16Q03308 798 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q DUS3Q06053 668 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR196WQ06595 470 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q ADE8P04161 214 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q STE13P33894 931 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q CUE2P36075 443 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q SIT1P39980 628 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q DAS1P47005 663 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q FAA4P47912 694 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q TPO2P53283 614 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERG5P54781 538 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q GDE1Q02979 1223 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q SVF1Q05515 481 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q BDF2Q07442 638 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q NOT3P06102 836 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q ABD1P32783 436 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q PEX19Q07418 342 aa3.35□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRM11Q12463 433 aa3.35□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q MET3P08536 511 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q CTF13P35203 478 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHL017WP38745 532 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q MBP1P39678 833 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q SDP1P40479 209 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q SLU7Q02775 382 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q ESC2Q06340 456 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q FAL1Q12099 399 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q NDJ1Q12366 352 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(UCA)QtW(UCA)Q PPH3P32345 308 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(UCA)QtW(UCA)Q MTH1P35198 433 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRP8P35719 219 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(UCA)QtW(UCA)Q VBA5P36172 582 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(UCA)QtW(UCA)Q CTF8P38877 133 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(UCA)QtW(UCA)Q CCM1P48237 864 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
tW(UCA)QtW(UCA)Q DLT1Q04216 342 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(UCA)QtW(UCA)Q PIN2Q12057 282 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(UCA)QtW(UCA)Q SWM1Q12379 170 aa3.33□□□□□ -1.88
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