RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	YBR284W	P38150	797 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	TAT2	P38967	592 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	YER158C	P40095	573 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	HUL5	P53119	910 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	GPB1	Q08886	897 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YKR070W	YKR070W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	POA1	P38218	177 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	GYP7	P48365	746 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	YGR012W	P53206	393 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	SFB2	P53953	876 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	CIT1	P00890	479 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.51	□□□□□ -1.53	not detected
YKR070W	YKR070W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	SRP101	P32916	621 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	SIT1	P39980	628 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	MND2	P40577	368 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	GCV2	P49095	1034 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	LCD1	Q04377	747 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	FLC1	Q08967	793 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	YPR071W	Q12346	211 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	HSF1	P10961	833 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	RPC82	P32349	654 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	NSE3	Q05541	303 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	YLR358C	O13565	187 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	BDF2	Q07442	638 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	NPP1	P25353	742 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	REC104	P33323	182 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	NPP2	P39997	493 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	VPS30	Q02948	557 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	YDR132C	Q03900	495 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	DUS4	Q06063	367 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	TPO1	Q07824	586 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	GAL11	P19659	1081 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	EMC1	P25574	760 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	DOM34	P33309	386 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	THI80	P35202	319 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	IOC3	P43596	787 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YKR070W	YKR070W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	TOK1	P40310	691 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.46	□□□□□ -1.54	not detected
YKR070W	YKR070W	YAP6	Q03935	383 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	CDA1	Q06702	301 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	SPE1	P08432	466 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.45	□□□□□ -1.54	not detected
YKR070W	YKR070W	CDC20	P26309	610 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	AFR1	P33304	620 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	PET10	P36139	283 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	ERT1	P38140	529 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	OCA5	P38738	679 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	MET12	P46151	657 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	HMI1	Q12039	706 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	ATG19	P35193	415 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	NIT3	P49954	291 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	TAF8	Q03750	510 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	CAN1	P04817	590 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	HIS5	P07172	385 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	TOP3	P13099	656 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	CEP3	P40969	608 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	VPS62	P53285	467 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	ADY3	Q07732	790 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	ESC8	Q08119	714 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	CDC6	P09119	513 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	YKL222C	P35995	705 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.42	□□□□□ -1.54	not detected
YKR070W	YKR070W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	YLR224W	Q05947	369 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	STE13	P33894	931 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	PLB1	P39105	664 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	YKE2	P52553	114 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	TMA10	Q06177	86 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	MPH2	P0CD99	609 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	BET3	P36149	193 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	FLR1	P38124	548 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
YKR070W	YKR070W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.39	□□□□□ -1.55	not detected
YKR070W	YKR070W	SED4	P25365	1065 aa		5.39	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.1 ms