RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	PNT1	P38969	423 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	MTC3	P53077	123 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	YGR122W	P53272	402 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	YLL058W	Q12198	575 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	FUN30	P31380	1131 aa		3	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	TDP1	P38319	544 aa		3	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	SED4	P25365	1065 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	RAD27	P26793	382 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	THI12	P42883	340 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	THI5	P43534	340 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	THI11	P47183	340 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	THI13	Q07748	340 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	MDM38	Q08179	573 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	RLF2	Q12495	606 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	CDC43	P18898	376 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	UPC2	Q12151	913 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	RAD2	P07276	1031 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	MET3	P08536	511 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	SRT1	Q03175	343 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	SUT2	Q12286	268 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	TRM13	Q12383	476 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM16	YJL104W	GCR1	P07261	785 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	RPC82	P32349	654 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	RER2	P35196	286 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	PPS1	P38148	807 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	SCS3	P53012	380 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	FRE5	Q08908	694 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	GIC1	P38785	314 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	YIL166C	P40445	542 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	TAH11	P47112	604 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	THI7	Q05998	598 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	WHI5	Q12416	295 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	FLO10	P36170	1169 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	ELO3	P40319	345 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	DLT1	Q04216	342 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	ARO10	Q06408	635 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	CYC8	P14922	966 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	ERG5	P54781	538 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	HRQ1	Q05549	1077 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	PEX19	Q07418	342 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	KIN3	P22209	435 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	STE14	P32584	239 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	ADY4	Q05955	493 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	RTT10	Q08924	1013 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	RKM4	Q12504	494 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	ADY2	P25613	283 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	YKL151C	P36059	337 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
PAM16	YJL104W	LYP1	P32487	611 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	YKL107W	P34251	309 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	CTF13	P35203	478 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	YPR196W	Q06595	470 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	TRM11	Q12463	433 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	INO1	P11986	533 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	YUR1	P26725	428 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	SEC20	P28791	383 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	ORC2	P32833	620 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	PCL5	P38794	229 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	RIA1	P53893	1110 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	DMC1	P25453	334 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	GAT1	P43574	510 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	SFB2	P53953	876 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	CRR1	Q05790	422 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	YPL066W	Q12194	479 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	SPO11	P23179	398 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	YGL176C	P46945	554 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	SWM1	Q12379	170 aa		2.87	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	NPP2	P39997	493 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	PUS2	P53167	370 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	DAM1	P53267	343 aa		2.86	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	YJL163C	P46996	555 aa		2.85	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	VPS30	Q02948	557 aa		2.85	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	SDP1	P40479	209 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	STB2	P46679	850 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	MUP1	P50276	574 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	TYW3	P53177	273 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PAM16	YJL104W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.84	□□□□□ -1.95	not detected

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