RNA–Protein interactions for RNA: YDR119W

VBA4, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene VBA4, Length 2,307 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA4YDR119W VTI1Q04338 217 aa3.6□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W PEX15Q08215 383 aa3.6□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W YOL114CQ12322 202 aa3.6□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W NAT1P12945 854 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W MCM7P38132 845 aa3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W CAF16P43569 289 aa3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W RET2P43621 546 aa3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W BFA1P47113 574 aa3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W YGR153WP48238 217 aa3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W RBG2P53295 368 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W SAS4Q04003 481 aa3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W YDR286CQ05530 114 aa3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W CIA1Q05583 330 aa3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W AOS1Q06624 347 aa3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W HIM1Q06674 414 aa3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
VBA4YDR119W RPC31P17890 251 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W ACE2P21192 770 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W RET1P22276 1149 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W RAD16P31244 790 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W IRE1P32361 1115 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.84not detected
VBA4YDR119W YKU70P32807 602 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W SEG2P34250 1132 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W MUD2P36084 527 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W RIM11P38615 370 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W CCT3P39077 534 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W DLD3P39976 496 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W RAD26P40352 1085 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.84not detected
VBA4YDR119W YML6P51998 286 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W CNM67P53865 581 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W MRPL19P53875 158 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W SKY1Q03656 742 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W SPO71Q03868 1245 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W TDA9Q04545 1251 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W DFG5Q05031 458 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W SGD1Q06132 899 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W BRE4Q07660 1125 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W DPH6Q12429 685 aa3.59□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W ENA1P13587 1091 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W DBP5P20449 482 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W MSH1P25846 959 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W CMK1P27466 446 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W MDJ1P35191 511 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W SRP72P38688 640 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W SIT1P39980 628 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W NOP16P40007 231 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W UPF3P48412 387 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W AIM14P53109 570 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W ENA2Q01896 1091 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W HAP5Q02516 242 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W EST2Q06163 884 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W YPL191CQ08930 360 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W TAH18Q12181 623 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W ENA5Q12691 1091 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W GFA1P14742 717 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W RGP1P16664 663 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W AAC3P18238 307 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W PAH1P32567 862 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W LRP1P38801 184 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W SIP5P40210 489 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W YTA6P40328 754 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W ECM9Q02202 377 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W TIM50Q02776 476 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W GRX3Q03835 250 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W TAF11Q04226 346 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W YKU80Q04437 629 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W ATG33Q06485 197 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W PGC1Q08959 321 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W LAP2Q10740 671 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W YPR027CQ12079 277 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W WSC3Q12215 556 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W SMC6Q12749 1114 aa3.58□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W HOG1P32485 435 aa3.57□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W POP2P39008 433 aa3.57□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W RGA1P39083 1007 aa3.57□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W JEM1P40358 645 aa3.57□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W CCT5P40413 562 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W YIL165CP40446 119 aa3.57□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W ARA2Q04212 335 aa3.57□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W RSC3Q06639 885 aa3.57□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W BI4P03879 638 aa3.56□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W HMG1P12683 1054 aa3.56□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W DAL7P21826 554 aa3.56□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W SIS1P25294 352 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W MXR1P40029 184 aa3.56□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W IRC6P43615 237 aa3.56□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W VPS53P47061 822 aa3.56□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W ZIP2P53061 704 aa3.56□□□□□ -1.84
VBA4YDR119W PCL10P53124 433 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.8 ms