RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636248.1

AC005972.4-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC005972.4, Length 1,131 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005972.4-201ENST00000636248 EML3Q32P44 896 aa8.64□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.64□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.64□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.64□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.63□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.63□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.63□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.63□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 NOD1Q9Y239 953 aa8.63□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.63□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.62□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.62□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 SMTNP53814 917 aa8.62□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 NCOA4Q13772 614 aa8.62□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.62□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 SVOPQ8N4V2 548 aa8.62□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.62□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 ATP10AO60312 1499 aa8.62□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.62□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 USP17L5A8MUK1 530 aa8.61□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 THBS1P07996 1170 aa8.61□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 MSX1P28360 303 aa8.61□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 GTF2IP78347 998 aa8.61□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 MBIPQ9NS73 344 aa8.61□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 C3P01024 1663 aa8.6□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.6□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 RUBCNLQ9H714 662 aa8.6□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.6□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.6□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 IGF1RP08069 1367 aa8.6□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.59□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 YY1P25490 414 aa8.59□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 PLA2G4AP47712 749 aa8.59□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.59□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.59□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 PGBD3Q8N328 593 aa8.59□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 UCN2Q96RP3 112 aa8.59□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.59□□□□□ -1.03
AC005972.4-201ENST00000636248 NPATQ14207 1427 aa8.58□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 A6NJY4 79 aa8.58□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 ARHGEF15O94989 841 aa8.58□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 RXRBP28702 533 aa8.58□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 PSME1Q06323 249 aa8.58□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 ABCA8O94911 1581 aa8.57□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.57□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 CDK2AP1O14519 115 aa8.57□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 MTFR1Q15390 333 aa8.57□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.57□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 USP3Q9Y6I4 520 aa8.57□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.57□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 HECW1Q76N89 1606 aa8.57□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 USP17L3A6NCW0 530 aa8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 USP17L4A6NCW7 530 aa8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 MX2P20592 715 aa8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 EFHC2Q5JST6 749 aa8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 AIDAQ96BJ3 306 aa8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 ZNF358Q9NW07 568 aa8.56□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 BACH1O14867 736 aa8.55□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 ATP9BO43861 1147 aa8.55□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 TRIM50Q86XT4 487 aa8.55□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 ATP4AP20648 1035 aa8.54□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 MAP3K10Q02779 954 aa8.54□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 GLMNQ92990 594 aa8.54□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.54□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 PHF24Q9UPV7 400 aa8.54□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.54□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.53□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 KCNMA1Q12791 1236 aa8.53□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.53□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 ACDQ96AP0 544 aa8.53□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 CABP1Q9NZU7 370 aa8.53□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.53□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.53□□□□□ -1.04
AC005972.4-201ENST00000636248 ATP10BO94823 1461 aa8.52□□□□□ -1.05
AC005972.4-201ENST00000636248 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.52□□□□□ -1.05
AC005972.4-201ENST00000636248 A6NJR5 290 aa8.52□□□□□ -1.05
AC005972.4-201ENST00000636248 GSK3AP49840 483 aa8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms