RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 SAMD9Q5K651 1589 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 HOXC9P31274 260 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 IQCA1Q86XH1 822 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 LINS1Q8NG48 757 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 HAND2P61296 217 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 HSPA2P54652 639 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 PRM3Q9NNZ6 103 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ESPNB1AK53 854 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CCP110O43303 1012 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CAGE1Q8TC20 777 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP170Q5SW79 1584 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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PTPRJ-208ENST00000615445 IP6K1Q92551 441 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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PTPRJ-208ENST00000615445 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 STX6O43752 255 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 C8orf34Q49A92 452 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 SMC5Q8IY18 1101 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
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PTPRJ-208ENST00000615445 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 TEX35Q5T0J7 233 aa24.17■■□□□ 1.46
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PTPRJ-208ENST00000615445 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CBFA2T2O43439 604 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ODF2Q5BJF6 829 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 TMX3Q96JJ7 454 aa24.16■■□□□ 1.46
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PTPRJ-208ENST00000615445 PPFIA3O75145 1194 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP10AO60312 1499 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 USP16Q9Y5T5 823 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 IL2RBP14784 551 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 C6orf229H3BNL8 230 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 HSP90B2PQ58FF3 399 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.15■■□□□ 1.46
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PTPRJ-208ENST00000615445 SMTNL1A8MU46 457 aa24.14■■□□□ 1.46
PTPRJ-208ENST00000615445 AK7Q96M32 723 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP2B3Q16720 1220 aa24.13■■□□□ 1.45
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PTPRJ-208ENST00000615445 ACBD3Q9H3P7 528 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
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PTPRJ-208ENST00000615445 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 BRF1Q92994 677 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 CFAP100Q494V2 611 aa24.12■■□□□ 1.45
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PTPRJ-208ENST00000615445 G2E3Q7L622 706 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF76P36508 570 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP6V1AP38606 617 aa24.11■■□□□ 1.45
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