RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP2R1AP30153 589 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ERFEQ4G0M1 354 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SRGNP10124 158 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-211ENST00000590874 STYK1Q6J9G0 422 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-211ENST00000590874 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-211ENST00000590874 LTBP3Q9NS15 1303 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-211ENST00000590874 DPY19L2Q6NUT2 758 aa34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-211ENST00000590874 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-211ENST00000590874 CNKSR1Q969H4 720 aa34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TAOK3Q9H2K8 898 aa34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-211ENST00000590874 DCTN1Q14203 1278 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MASTLQ96GX5 879 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-211ENST00000590874 SLX4Q8IY92 1834 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC4GQ6UXB4 293 aa34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF26B4DH59 902 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF15Q8N660 670 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-211ENST00000590874 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF652Q9Y2D9 606 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-211ENST00000590874 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNA1SQ13698 1873 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-211ENST00000590874 SOGA3Q5TF21 947 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-211ENST00000590874 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-211ENST00000590874 DDNO94850 711 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-211ENST00000590874 C7orf43Q8WVR3 580 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-211ENST00000590874 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-211ENST00000590874 MIS18AQ9NYP9 233 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-211ENST00000590874 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-211ENST00000590874 POTEIP0CG38 1075 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-211ENST00000590874 POTEJP0CG39 1038 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-211ENST00000590874 NPR1P16066 1061 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-211ENST00000590874 RGL2O15211 777 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC93Q567U6 631 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TPTE2Q6XPS3 522 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM177BA6PVY3 158 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-211ENST00000590874 HLFQ16534 295 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-211ENST00000590874 CHADLQ6NUI6 762 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-211ENST00000590874 OLFM4Q6UX06 510 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMB4A4D0S4 1761 aa34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-211ENST00000590874 PCNTO95613 3336 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-211ENST00000590874 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF541Q9H0D2 1346 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-211ENST00000590874 NGEFQ8N5V2 710 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-211ENST00000590874 CREBZFQ9NS37 354 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCC12Q96J65 1359 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCA1LA6NCM1 817 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM3BQ7LBC6 1761 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHF1Q96S99 279 aa34.02■■■■□ 3.04
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 RTKN2Q8IZC4 609 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 TNS4Q8IZW8 715 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 LDHDQ86WU2 507 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 NUTM1Q86Y26 1132 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 NEFMP07197 916 aa33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 SNED1Q8TER0 1413 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVV-1B6SEH8 477 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH1B1P30837 517 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 CRY2Q49AN0 593 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 TTLL7Q6ZT98 887 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 PASKQ96RG2 1323 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 DLG5Q8TDM6 1919 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 SCN4AP35499 1836 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 IARSP41252 1262 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 NFE2L2Q16236 605 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNE4Q8N205 404 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 NYXQ9GZU5 481 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPN15O75808 1086 aa33.95■■■■□ 3.03
CAPNS1-211ENST00000590874 MYL6BP14649 208 aa33.94■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF6Q6ZMV9 814 aa33.94■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 UBN2Q6ZU65 1347 aa33.94■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 FZD9O00144 591 aa33.93■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 GPTP24298 496 aa33.93■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB3Q9H5J0 574 aa33.93■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 HACL1Q9UJ83 578 aa33.93■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTNAP1P78357 1384 aa33.91■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF123Q5XPI4 1314 aa33.91■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMD1Q99460 953 aa33.91■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 RIC1Q4ADV7 1423 aa33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHX2P34913 555 aa33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SUSD4Q5VX71 490 aa33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP98P52948 1817 aa33.9■■■■□ 3.02
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