RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.6■■□□□ 1.53
INO80E-212ENST00000568043 STYK1Q6J9G0 422 aa24.6■■□□□ 1.53
INO80E-212ENST00000568043 CNBD1Q8NA66 436 aa24.6■■□□□ 1.53
INO80E-212ENST00000568043 CNKSR1Q969H4 720 aa24.6■■□□□ 1.53
INO80E-212ENST00000568043 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.59■■□□□ 1.53
INO80E-212ENST00000568043 PASKQ96RG2 1323 aa24.59■■□□□ 1.53
INO80E-212ENST00000568043 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.58■■□□□ 1.53
INO80E-212ENST00000568043 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
INO80E-212ENST00000568043 MASTLQ96GX5 879 aa24.57■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.57■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 USP16Q9Y5T5 823 aa24.57■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 CNTNAP1P78357 1384 aa24.56■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.56■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 FOXN1O15353 648 aa24.56■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.56■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 ST5P78524 1137 aa24.55■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.55■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 OLFM4Q6UX06 510 aa24.54■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.53■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 LDHDQ86WU2 507 aa24.53■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 BTBD11A6QL63 1104 aa24.52■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 NPHP1O15259 732 aa24.52■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 SOGA3Q5TF21 947 aa24.52■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.52■■□□□ 1.52
INO80E-212ENST00000568043 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.5■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 VEGFBP49765 207 aa24.5■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 CCDC93Q567U6 631 aa24.49■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.49■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 NPR1P16066 1061 aa24.48■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 NBPF26B4DH59 902 aa24.47■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 NBPF15Q8N660 670 aa24.47■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.47■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.47■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.46■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.46■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 PRKAR2BP31323 418 aa24.46■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
INO80E-212ENST00000568043 SNED1Q8TER0 1413 aa24.44■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 HACL1Q9UJ83 578 aa24.44■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 EPHX2P34913 555 aa24.43■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 WBP1LQ9NX94 342 aa24.43■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.42■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 FAM177BA6PVY3 158 aa24.42■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 FZD9O00144 591 aa24.42■■□□□ 1.5
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INO80E-212ENST00000568043 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 HLFQ16534 295 aa24.42■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.42■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 MCM10Q7L590 875 aa24.42■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.42■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 COL4A5P29400 1685 aa24.42■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 LTBP1Q14766 1721 aa24.41■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.41■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 NUP98P52948 1817 aa24.4■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 LBX1P52954 281 aa24.4■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 DCTN1Q14203 1278 aa24.4■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.4■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 CNTROBQ8N137 903 aa24.4■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 SYNE4Q8N205 404 aa24.4■■□□□ 1.5
INO80E-212ENST00000568043 RASSF10A6NK89 507 aa24.39■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 RGL2O15211 777 aa24.38■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 AIDAQ96BJ3 306 aa24.38■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 SLC51AQ86UW1 340 aa24.37■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 ABCC12Q96J65 1359 aa24.37■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.37■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.36■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 ALDH1B1P30837 517 aa24.35■■□□□ 1.49
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INO80E-212ENST00000568043 CRY2Q49AN0 593 aa24.35■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 GPC2Q8N158 579 aa24.35■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.34■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 PSMD1Q99460 953 aa24.34■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.34■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.33■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
INO80E-212ENST00000568043 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.32■■□□□ 1.48
INO80E-212ENST00000568043 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
INO80E-212ENST00000568043 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
INO80E-212ENST00000568043 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
INO80E-212ENST00000568043 THSD7BQ9C0I4 1608 aa24.31■■□□□ 1.48
INO80E-212ENST00000568043 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.3■■□□□ 1.48
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