RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548971.5

TARBP2-209, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, humanhuman

TSL 5

Gene TARBP2, Length 1,493 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP2-209ENST00000548971 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.19■■□□□ 1.78
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TARBP2-209ENST00000548971 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.19■■□□□ 1.78
TARBP2-209ENST00000548971 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.19■■□□□ 1.78
TARBP2-209ENST00000548971 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.18■■□□□ 1.78
TARBP2-209ENST00000548971 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.18■■□□□ 1.78
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TARBP2-209ENST00000548971 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.15■■□□□ 1.78
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TARBP2-209ENST00000548971 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.04■■□□□ 1.76
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TARBP2-209ENST00000548971 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26■■□□□ 1.75
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TARBP2-209ENST00000548971 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26■■□□□ 1.75
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TARBP2-209ENST00000548971 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.98■■□□□ 1.75
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TARBP2-209ENST00000548971 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.97■■□□□ 1.75
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TARBP2-209ENST00000548971 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.94■■□□□ 1.74
TARBP2-209ENST00000548971 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
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TARBP2-209ENST00000548971 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.94■■□□□ 1.74
TARBP2-209ENST00000548971 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
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