RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524057.3

SORBS3-222, Transcript of sorbin and SH3 domain containing 3, human

TSL 3

Gene SORBS3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SORBS3-222	ENST00000524057	TSKS	Q9UJT2	592 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	CAPNS2	Q96L46	248 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	SLX4	Q8IY92	1834 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057		A0A087WZG4	1122 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	14.74	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	MASTL	Q96GX5	879 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	ECE1	P42892	770 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	GRM1	Q13255	1194 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	FZD9	O00144	591 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	AOC2	O75106	756 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	STARD3NL	O95772	234 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	14.71	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	CCDC93	Q567U6	631 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	CST9	Q5W186	159 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	CNBD1	Q8NA66	436 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	SETDB2	Q96T68	719 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SORBS3-222	ENST00000524057	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	MAP2K2	P36507	400 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	OLFM4	Q6UX06	510 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	GPC2	Q8N158	579 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	NPHP1	O15259	732 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	ST5	P78524	1137 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	IL13	P35225	146 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	DGKZ	Q13574	1117 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	SYNE4	Q8N205	404 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	TRAF5	O00463	557 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	CAMTA2	O94983	1202 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	NPR1	P16066	1061 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	CA12	O43570	354 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	PANK3	Q9H999	370 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	EPS15	P42566	896 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	CACNA1S	Q13698	1873 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SORBS3-222	ENST00000524057	MRC1	P22897	1456 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	A1BG	P04217	495 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	JDP2	Q8WYK2	163 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	SCNN1D	P51172	638 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	LTBP1	Q14766	1721 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	HMOX1	P09601	288 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	ALDH1B1	P30837	517 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	SOX10	P56693	466 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	ZNF790	Q6PG37	636 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	MORC1	Q86VD1	984 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	PSMD1	Q99460	953 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		14.6	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		14.6	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		14.6	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	SCN7A	Q01118	1682 aa		14.6	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	ZIC5	Q96T25	663 aa		14.59	□□□□□ -0.07
SORBS3-222	ENST00000524057	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SORBS3-222	ENST00000524057	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SORBS3-222	ENST00000524057	COL4A5	P29400	1685 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SORBS3-222	ENST00000524057	SNED1	Q8TER0	1413 aa		14.58	□□□□□ -0.08
SORBS3-222	ENST00000524057	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
SORBS3-222	ENST00000524057	USP16	Q9Y5T5	823 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SORBS3-222	ENST00000524057	FAM177B	A6PVY3	158 aa		14.56	□□□□□ -0.08

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