RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520166.5

TSNARE1-205, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-205ENST00000520166 IGKV5-2P06315 115 aa21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 MEIS3Q99687 375 aa21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 MYD88Q99836 296 aa21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.53■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 RREB1Q92766 1687 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-205ENST00000520166 GNPATO15228 680 aa21.52■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.52■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 USP44Q9H0E7 712 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 C4BP0C0L5 1744 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 RPS6KA4O75676 772 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 PHF14O94880 888 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 COL15A1P39059 1388 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF827Q17R98 1081 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CAMTA2O94983 1202 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 LINS1Q8NG48 757 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ATP10DQ9P241 1426 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 AK7Q96M32 723 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 IGHDP01880 384 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 GPTP24298 496 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-205ENST00000520166 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 TCIRG1Q13488 830 aa21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 GCKRQ14397 625 aa21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ALDH1L1O75891 902 aa21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 AKT1S1Q96B36 256 aa21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.43■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 SYNE4Q8N205 404 aa21.42■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 KAZALD1Q96I82 304 aa21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 NUP98P52948 1817 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-205ENST00000520166 FAM177BA6PVY3 158 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 GRM8O00222 908 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 NARFQ9UHQ1 456 aa21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 A0A087WZG4 1122 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 NLRP10Q86W26 655 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 SUCLG2Q96I99 432 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 BAG6P46379 1132 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 CASP7P55210 303 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 GNAI2P04899 355 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 GNAI3P08754 354 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 RFC4P35249 363 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 CEP85Q6P2H3 762 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 ILDR2Q71H61 639 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 SKAP1Q86WV1 359 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 UTYO14607 1347 aa21.37■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 SUSD4Q5VX71 490 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-205ENST00000520166 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms