RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 SWAP70Q9UH65 585 aa10.79□□□□□ -0.68
RABGGTB-214ENST00000497648 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-214ENST00000497648 STK10O94804 968 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-214ENST00000497648 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-214ENST00000497648 PAX3P23760 479 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-214ENST00000497648 DMTNQ08495 405 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-214ENST00000497648 MTRQ99707 1265 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-214ENST00000497648 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-214ENST00000497648 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-214ENST00000497648 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.77□□□□□ -0.68
RABGGTB-214ENST00000497648 BICDL2A1A5D9 508 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 PREX1Q8TCU6 1659 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 NAIPQ13075 1403 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 CNTLNQ9NXG0 1405 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 CBFA2T2O43439 604 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 DDRGK1Q96HY6 314 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM117AQ9C073 453 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 ZMYM3Q14202 1370 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP6V1AP38606 617 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 COPS2P61201 443 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 MORN1Q5T089 497 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF516Q92618 1163 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 SMC3Q9UQE7 1217 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 CEP83Q9Y592 693 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 LMTK3Q96Q04 1460 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 HFM1A2PYH4 1435 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 E9PCH4 1651 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 TET3O43151 1660 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 VGLL3A8MV65 326 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 VDRP11473 427 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 NEXNQ0ZGT2 675 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 ICE2Q659A1 982 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 HLA-CQ95604 372 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 IL21Q9HBE4 155 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 PZPP20742 1482 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 HOXA2O43364 376 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 CLUAP1Q96AJ1 413 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 SCYL1Q96KG9 808 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 EFCC1Q9HA90 598 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 CD151P48509 253 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 USP46P62068 366 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 C4orf46Q504U0 113 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 MPNDQ8N594 471 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 ATL2Q8NHH9 583 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 PMM1Q92871 262 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 NPATQ14207 1427 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 ZPR1O75312 459 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 BDNFP23560 247 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 GYS2P54840 703 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 IFFO2Q5TF58 517 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 MYO5BQ9ULV0 1848 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 SYNMO15061 1565 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 CTAGE5O15320 804 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 GUCA2AQ02747 115 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNC4Q03721 635 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 KLHL10Q6JEL2 608 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 ERVK-7P63135 1459 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 MOXD2PA6NHM9 499 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RABGGTB-214ENST00000497648 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms