RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 KLRG1Q96E93 195 aa26.57■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.56■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 ST5P78524 1137 aa26.55■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.55■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.55■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.55■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 SRGNP10124 158 aa26.54■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 STYK1Q6J9G0 422 aa26.54■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 JMYQ8N9B5 988 aa26.54■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 CNKSR1Q969H4 720 aa26.54■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 DCTN1Q14203 1278 aa26.53■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 POTECB2RU33 542 aa26.52■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 MASTLQ96GX5 879 aa26.52■■□□□ 1.84
NELFE-212ENST00000492539 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.51■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 RGL2O15211 777 aa26.51■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 NPHP1O15259 732 aa26.51■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.51■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 PCNTO95613 3336 aa26.5■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 NBPF26B4DH59 902 aa26.5■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 ERFEQ4G0M1 354 aa26.5■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.5■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 NBPF15Q8N660 670 aa26.5■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.5■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 SOGA3Q5TF21 947 aa26.48■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
NELFE-212ENST00000492539 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.45■■□□□ 1.82
NELFE-212ENST00000492539 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
NELFE-212ENST00000492539 NUP98P52948 1817 aa26.44■■□□□ 1.82
NELFE-212ENST00000492539 NPR1P16066 1061 aa26.43■■□□□ 1.82
NELFE-212ENST00000492539 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.43■■□□□ 1.82
NELFE-212ENST00000492539 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.42■■□□□ 1.82
NELFE-212ENST00000492539 HLFQ16534 295 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-212ENST00000492539 CCDC93Q567U6 631 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-212ENST00000492539 SCN4AP35499 1836 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-212ENST00000492539 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
NELFE-212ENST00000492539 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
NELFE-212ENST00000492539 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.4■■□□□ 1.82
NELFE-212ENST00000492539 NEFMP07197 916 aa26.38■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 FAM177BA6PVY3 158 aa26.36■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 CHADLQ6NUI6 762 aa26.36■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.35■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 NFE2L2Q16236 605 aa26.35■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 SNED1Q8TER0 1413 aa26.34■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 POTEIP0CG38 1075 aa26.34■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 POTEJP0CG39 1038 aa26.34■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 ABCC12Q96J65 1359 aa26.33■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 ALDH1B1P30837 517 aa26.33■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 OLFM4Q6UX06 510 aa26.33■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.33■■□□□ 1.81
NELFE-212ENST00000492539 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.32■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.32■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 CRY2Q49AN0 593 aa26.32■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.32■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 NYXQ9GZU5 481 aa26.32■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.31■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 NGEFQ8N5V2 710 aa26.31■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.3■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.3■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.29■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.29■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 CREBZFQ9NS37 354 aa26.29■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 LDHDQ86WU2 507 aa26.28■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.28■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.28■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 MYL6BP14649 208 aa26.27■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 ERBB4Q15303 1308 aa26.27■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 PASKQ96RG2 1323 aa26.27■■□□□ 1.8
NELFE-212ENST00000492539 FZD9O00144 591 aa26.26■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 SYNE4Q8N205 404 aa26.26■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 PSMD1Q99460 953 aa26.26■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.25■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.25■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 SUSD4Q5VX71 490 aa26.24■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 GPTP24298 496 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
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