RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 SLIT1O75093 1534 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 ADGRB1O14514 1584 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 RFX1P22670 979 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 MED14O60244 1454 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 PPLO60437 1756 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 GRM5P41594 1212 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 HSPA2P54652 639 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 METP08581 1390 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 ATG7O95352 703 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 KIF1BO60333 1816 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 NCOA4Q13772 614 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 PTPRUQ92729 1446 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 TESK2Q96S53 571 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 CARD11Q9BXL7 1154 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 ALKQ9UM73 1620 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 USP47Q96K76 1375 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 GDF9O60383 454 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 ADH1CP00326 375 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.023e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-212ENST00000491266 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-212ENST00000491266 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM196BA6NMK8 535 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 FSHRP23945 695 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 NR5A1Q13285 461 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 EML3Q32P44 896 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 RETREG2Q8NC44 543 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 STK26Q9P289 416 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 TBX22Q9Y458 520 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 RGS20O76081 388 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 PRR20EP86478 221 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 PRR20CP86479 221 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 PRR20DP86480 221 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 PRR20BP86481 221 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 PRR20AP86496 221 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 ARID5BQ14865 1188 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 CDCA8Q53HL2 280 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 NOD1Q9Y239 953 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 IQGAP1P46940 1657 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 LAMC1P11047 1609 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 ABCC11Q96J66 1382 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 DKK1O94907 266 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 NR3C2P08235 984 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 ERVK-9P63128 1117 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 PTK7Q13308 1070 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 USTQ9Y2C2 406 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 EID1Q9Y6B2 187 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-212ENST00000491266 USP17L15C9J2P7 530 aa8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms