RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473186.5

KMT2C-208, Transcript of lysine methyltransferase 2C, human

TSL 1 (best)

Gene KMT2C, Length 12,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KMT2C-208	ENST00000473186	SPAG1	Q07617	926 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TUBB	P07437	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	STX6	O43752	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SLC5A1	P13866	664 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ZNF213	O14771	459 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CABP2	Q9NPB3	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	GNAQ	P50148	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	GSTO1	P78417	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	RGS22	Q8NE09	1264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NCOA2	Q15596	1464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SSFA2	P28290	1259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PRAM1	Q96QH2	718 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	MX1	P20591	662 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NDC80	O14777	642 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	MCM5	P33992	734 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	MYL6B	P14649	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	GPR162	Q16538	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63	3e-7	■■□□□ 13.2
KMT2C-208	ENST00000473186	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PTPRC	P08575	1304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	TSPOAP1	O95153	1857 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ZWINT	O95229	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	ALDH3A1	P30838	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KMT2C-208	ENST00000473186	MAP3K9	P80192	1104 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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