RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442067.5

GAS5-215, Transcript of growth arrest specific 5, humanhuman

TSL 2

Gene GAS5, Length 1,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAS5-215ENST00000442067 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 RNF34Q969K3 372 aa7□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 TINF2Q9BSI4 451 aa7□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 TGIF2Q9GZN2 237 aa7□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 NLRP2Q9NX02 1062 aa7□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 TIAM1Q13009 1591 aa6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 IFT140Q96RY7 1462 aa6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 RAB11FIP3O75154 756 aa6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 CLDN10P78369 228 aa6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 FGD1P98174 961 aa6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 PBRM1Q86U86 1689 aa6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 SAMD9Q5K651 1589 aa6.99□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 PPFIA3O75145 1194 aa6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 CLSTN1O94985 981 aa6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 ARHGAP4P98171 946 aa6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 MTMR3Q13615 1198 aa6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 OCLNQ16625 522 aa6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 TMC1Q8TDI8 760 aa6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 HINFPQ9BQA5 517 aa6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 SEPT3Q9UH03 358 aa6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.98□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 ADAMTS12P58397 1594 aa6.97□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.97□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 ARMC5Q96C12 935 aa6.97□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 FAM161BQ96MY7 647 aa6.97□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.97□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.97□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.97□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.97□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 GRIN2BQ13224 1484 aa6.97□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.97□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.96□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
GAS5-215ENST00000442067 SORBS3O60504 671 aa6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 MAPK8P45983 427 aa6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 PSME1Q06323 249 aa6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 ECM1Q16610 540 aa6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 PTPROQ16827 1216 aa6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 SIX5Q8N196 739 aa6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 PARP2Q9UGN5 583 aa6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.96□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 NDUFB5O43674 189 aa6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 LGR5O75473 907 aa6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 ZNF76P36508 570 aa6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 ANAPC15P60006 121 aa6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 SOGA3Q5TF21 947 aa6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 CCDC102BQ68D86 513 aa6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 TMC7Q7Z402 723 aa6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 PPME1Q9Y570 386 aa6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 FMN1Q68DA7 1419 aa6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 SFI1A8K8P3 1242 aa6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 GTF2IP78347 998 aa6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 FANCCQ00597 558 aa6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 PTK2Q05397 1052 aa6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 PSMD2Q13200 908 aa6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.33e-39■■■□□ 14.8
GAS5-215ENST00000442067 SPACA7Q96KW9 195 aa6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 PIF1Q9H611 641 aa6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.93□□□□□ -1.3
GAS5-215ENST00000442067 TTLL8A6PVC2 850 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.3 ms