RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 MYOM1P52179 1685 aa9.38□□□□□ -0.91
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HOXD8-202ENST00000429017 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
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HOXD8-202ENST00000429017 TNS2Q63HR2 1409 aa9.37□□□□□ -0.91
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HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXD8-202ENST00000429017 TONSLQ96HA7 1378 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXD8-202ENST00000429017 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HOXD8-202ENST00000429017 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HOXD8-202ENST00000429017 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXD8-202ENST00000429017 USHBP1Q8N6Y0 703 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXD8-202ENST00000429017 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
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