RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 ERFEQ4G0M1 354 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 NUDCQ9Y266 331 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 BCORQ6W2J9 1755 aa22.12■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 FAM177BA6PVY3 158 aa22.11■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 NBPF26B4DH59 902 aa22.11■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 SRGNP10124 158 aa22.11■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 NBPF15Q8N660 670 aa22.11■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 JMYQ8N9B5 988 aa22.11■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 ST5P78524 1137 aa22.1■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.09■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 CNKSR1Q969H4 720 aa22.09■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.09■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 STYK1Q6J9G0 422 aa22.08■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 OLFM4Q6UX06 510 aa22.08■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 MASTLQ96GX5 879 aa22.08■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.08■■□□□ 1.13
VARS-216ENST00000428445 POTEIP0CG38 1075 aa22.07■■□□□ 1.12
VARS-216ENST00000428445 POTEJP0CG39 1038 aa22.07■■□□□ 1.12
VARS-216ENST00000428445 HLFQ16534 295 aa22.07■■□□□ 1.12
VARS-216ENST00000428445 NGEFQ8N5V2 710 aa22.07■■□□□ 1.12
VARS-216ENST00000428445 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
VARS-216ENST00000428445 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.05■■□□□ 1.12
VARS-216ENST00000428445 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
VARS-216ENST00000428445 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.04■■□□□ 1.12
VARS-216ENST00000428445 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.03■■□□□ 1.12
VARS-216ENST00000428445 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.02■■□□□ 1.12
VARS-216ENST00000428445 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.02■■□□□ 1.12
VARS-216ENST00000428445 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
VARS-216ENST00000428445 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.02■■□□□ 1.12
VARS-216ENST00000428445 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.01■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 NPR1P16066 1061 aa22■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 CCDC93Q567U6 631 aa21.98■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 CHADLQ6NUI6 762 aa21.98■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.98■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 CAPN15O75808 1086 aa21.97■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 SOGA3Q5TF21 947 aa21.97■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.97■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 SLC51AQ86UW1 340 aa21.97■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.97■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.97■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 MYL6BP14649 208 aa21.96■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
VARS-216ENST00000428445 NUP98P52948 1817 aa21.95■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 ABCC12Q96J65 1359 aa21.95■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 GPTP24298 496 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 SYNE4Q8N205 404 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.93■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 NFE2L2Q16236 605 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.91■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 NEFMP07197 916 aa21.91■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 TNS4Q8IZW8 715 aa21.91■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 RGL2O15211 777 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 ALDH1B1P30837 517 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 SUSD4Q5VX71 490 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 CREBZFQ9NS37 354 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 SCN4AP35499 1836 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-216ENST00000428445 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.88■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.88■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 LDHDQ86WU2 507 aa21.88■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 PASKQ96RG2 1323 aa21.87■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 FZD9O00144 591 aa21.87■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 ANXA1P04083 346 aa21.87■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 CRY2Q49AN0 593 aa21.87■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 NYXQ9GZU5 481 aa21.87■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 HACL1Q9UJ83 578 aa21.87■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 COL4A5P29400 1685 aa21.86■■□□□ 1.09
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