RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.68■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 GNPATO15228 680 aa25.67■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.67■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.67■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.66■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 PHF14O94880 888 aa25.66■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.66■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 PLSCR1O15162 318 aa25.65■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.64■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
TMCO3-201ENST00000375391 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 USP44Q9H0E7 712 aa25.64■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.64■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.64■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.63■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.62■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.61■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 COL15A1P39059 1388 aa25.61■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.61■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 GPTP24298 496 aa25.61■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF827Q17R98 1081 aa25.6■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.6■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.6■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.6■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 C4BP0C0L5 1744 aa25.6■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.6■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.6■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 LINS1Q8NG48 757 aa25.59■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 AK7Q96M32 723 aa25.59■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.59■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 RPS6KA4O75676 772 aa25.58■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 CAMTA2O94983 1202 aa25.58■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 IGHDP01880 384 aa25.58■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 RREB1Q92766 1687 aa25.58■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.58■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
TMCO3-201ENST00000375391 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.57■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.56■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 ATP10DQ9P241 1426 aa25.56■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.56■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.55■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 SYNE4Q8N205 404 aa25.55■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 TCIRG1Q13488 830 aa25.55■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 GCKRQ14397 625 aa25.55■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.55■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 FAM177BA6PVY3 158 aa25.54■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 SKAP1Q86WV1 359 aa25.54■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.54■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.53■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.52■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.52■■□□□ 1.68
TMCO3-201ENST00000375391 A0A087WZG4 1122 aa25.51■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 GRM8O00222 908 aa25.51■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 ALDH1L1O75891 902 aa25.51■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.51■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.51■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 AKT1S1Q96B36 256 aa25.51■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 KAZALD1Q96I82 304 aa25.51■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.51■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.5■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 NUP98P52948 1817 aa25.5■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 FAM89AQ96GI7 184 aa25.49■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 SUCLG2Q96I99 432 aa25.49■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.49■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 RFC4P35249 363 aa25.48■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 NLRP10Q86W26 655 aa25.48■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 NARFQ9UHQ1 456 aa25.48■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.48■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 GNAI2P04899 355 aa25.48■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.48■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 CEP85Q6P2H3 762 aa25.48■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.47■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 BAG6P46379 1132 aa25.47■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 ILDR2Q71H61 639 aa25.47■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.47■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms