RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 STRCQ7RTU9 1775 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 SLC39A7Q92504 469 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP53Q96M91 514 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 HSPA2P54652 639 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 MVPQ14764 893 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 MORC1Q86VD1 984 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 SULF1Q8IWU6 871 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 SMC5Q8IY18 1101 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 PNMA3Q9UL41 463 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.9□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 PANK1Q8TE04 598 aa8.9□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.9□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.9□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.9□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 SHPRHQ149N8 1683 aa8.9□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 KDM4AO75164 1064 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 DCCP43146 1447 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 C7P10643 843 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 MSNP26038 577 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 TATDN2Q93075 761 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJB2P25686 324 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 DDIT3P35638 169 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC17AQ6ZS10 378 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 ACEP12821 1306 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 FDX1P10109 184 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 PANK2Q9BZ23 570 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 LHX6Q9UPM6 363 aa8.87□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 USP6P35125 1406 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 FYB1O15117 783 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 IGSF3O75054 1194 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 BRD1O95696 1058 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 MCM5P33992 734 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 PROX2Q3B8N5 592 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 UCN2Q96RP3 112 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 KIF1AQ12756 1690 aa8.86□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 PRR7Q8TB68 274 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 IL16Q14005 1332 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 HOXA2O43364 376 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 OFD1O75665 1012 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 ATF3P18847 181 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL40Q2TBA0 621 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 MSH6P52701 1360 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM94Q12767 1356 aa8.85□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 COG3Q96JB2 828 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 ALG2Q9H553 416 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.84□□□□□ -0.99
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP99D6REC4 459 aa8.83□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 POTEIP0CG38 1075 aa8.83□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 NUCB2P80303 420 aa8.83□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 SSH2Q76I76 1423 aa8.83□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.83□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.83□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 USP54Q70EL1 1684 aa8.82□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.82□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 SLC10A3P09131 477 aa8.82□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 GJA5P36382 358 aa8.82□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 WASHC4Q2M389 1173 aa8.82□□□□□ -1
CTPS1-201ENST00000372616 GPR153Q6NV75 609 aa8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms