RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331444.10

DGCR6-201, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DGCR6, Length 1,214 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR6-201ENST00000331444 CNBD1Q8NA66 436 aa25.35■■□□□ 1.65
DGCR6-201ENST00000331444 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.35■■□□□ 1.65
DGCR6-201ENST00000331444 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.34■■□□□ 1.65
DGCR6-201ENST00000331444 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
DGCR6-201ENST00000331444 TNS4Q8IZW8 715 aa25.33■■□□□ 1.65
DGCR6-201ENST00000331444 MASTLQ96GX5 879 aa25.33■■□□□ 1.65
DGCR6-201ENST00000331444 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.33■■□□□ 1.65
DGCR6-201ENST00000331444 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
DGCR6-201ENST00000331444 NPHP1O15259 732 aa25.32■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.32■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 USP16Q9Y5T5 823 aa25.32■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 BTBD11A6QL63 1104 aa25.31■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 ST5P78524 1137 aa25.31■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 SOGA3Q5TF21 947 aa25.31■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 CHADLQ6NUI6 762 aa25.31■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 RGL2O15211 777 aa25.3■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 POTEIP0CG38 1075 aa25.3■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 POTEJP0CG39 1038 aa25.3■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 CREBZFQ9NS37 354 aa25.3■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25.3■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 PRKAR2BP31323 418 aa25.29■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.28■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.27■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 PASKQ96RG2 1323 aa25.27■■□□□ 1.64
DGCR6-201ENST00000331444 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 CFAP53Q96M91 514 aa25.25■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 NUP98P52948 1817 aa25.25■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 NBPF26B4DH59 902 aa25.24■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 NBPF15Q8N660 670 aa25.24■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.24■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 SNED1Q8TER0 1413 aa25.23■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.23■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 NPR1P16066 1061 aa25.23■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 CCDC93Q567U6 631 aa25.23■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 CNTNAP1P78357 1384 aa25.22■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 CAPN15O75808 1086 aa25.22■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 LDHDQ86WU2 507 aa25.22■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.22■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.21■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
DGCR6-201ENST00000331444 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 MCM10Q7L590 875 aa25.2■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 NUDCQ9Y266 331 aa25.2■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.19■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.18■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 OLFM4Q6UX06 510 aa25.17■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.17■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 FZD9O00144 591 aa25.15■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 PPP2R1AP30153 589 aa25.15■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 DCTN1Q14203 1278 aa25.15■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 HLFQ16534 295 aa25.15■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 CRY2Q49AN0 593 aa25.14■■□□□ 1.62
DGCR6-201ENST00000331444 FOXN1O15353 648 aa25.13■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 ALDH1B1P30837 517 aa25.13■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 COL4A5P29400 1685 aa25.13■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.12■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.12■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 PSMD1Q99460 953 aa25.12■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 HACL1Q9UJ83 578 aa25.12■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 LTBP1Q14766 1721 aa25.12■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 ABCC12Q96J65 1359 aa25.11■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 SYNE4Q8N205 404 aa25.11■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.11■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 EPHX2P34913 555 aa25.1■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 VEGFBP49765 207 aa25.1■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.09■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 GPC2Q8N158 579 aa25.09■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 FAM177BA6PVY3 158 aa25.08■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
DGCR6-201ENST00000331444 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.08■■□□□ 1.6
DGCR6-201ENST00000331444 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.07■■□□□ 1.6
DGCR6-201ENST00000331444 RASSF10A6NK89 507 aa25.07■■□□□ 1.6
DGCR6-201ENST00000331444 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
DGCR6-201ENST00000331444 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
DGCR6-201ENST00000331444 WBP1LQ9NX94 342 aa25.07■■□□□ 1.6
DGCR6-201ENST00000331444 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.07■■□□□ 1.6
DGCR6-201ENST00000331444 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.06■■□□□ 1.6
DGCR6-201ENST00000331444 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.06■■□□□ 1.6
DGCR6-201ENST00000331444 NYXQ9GZU5 481 aa25.06■■□□□ 1.6
DGCR6-201ENST00000331444 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.06■■□□□ 1.6
DGCR6-201ENST00000331444 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
DGCR6-201ENST00000331444 CNTROBQ8N137 903 aa25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms