RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGSF3O75054 1194 aa26.62■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 LIG1P18858 919 aa26.62■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 POLA2Q14181 598 aa26.62■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC6Q86TZ1 520 aa26.62■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRMPQ12912 555 aa26.62■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 ME3Q16798 604 aa26.62■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.61■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD7Q92527 254 aa26.61■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.61■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 NRBP1Q9UHY1 535 aa26.6■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.6■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 IL17REQ8NFR9 667 aa26.6■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC186Q7Z3E2 898 aa26.59■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.59■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26.59■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.59■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.58■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTIFO43310 598 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 VPS53Q5VIR6 699 aa26.58■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 TPM3P06753 285 aa26.58■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 TYRO3Q06418 890 aa26.58■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 AMPHP49418 695 aa26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP3K11Q16584 847 aa26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP31Q70CQ4 1352 aa26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP6P35125 1406 aa26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 KDRP35968 1356 aa26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 DRC7Q8IY82 874 aa26.55■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.55■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANO6Q4KMQ2 910 aa26.54■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.54■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 CBX8Q9HC52 389 aa26.54■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 DACT1Q9NYF0 836 aa26.54■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.54■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.53■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 SIRT1Q96EB6 747 aa26.53■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.53■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT85P78386 507 aa26.53■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 FLT4P35916 1363 aa26.52■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANXA1P04083 346 aa26.52■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNMDQ9H2S6 317 aa26.52■■□□□ 1.84
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM5Q9C035 493 aa26.51■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 NECTIN1Q15223 517 aa26.51■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP3K5Q99683 1374 aa26.51■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 TECPR2O15040 1411 aa26.5■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 SBNO1A3KN83 1393 aa26.5■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.5■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.5■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.49■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM227BQ96M60 508 aa26.49■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.49■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNJ4P48050 445 aa26.48■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.48■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.48■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNNT1P13805 278 aa26.48■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.48■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.48■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF75DP51815 510 aa26.47■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 BEND3Q5T5X7 828 aa26.47■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.47■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.47■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.47■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.47■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLHL34Q8N239 644 aa26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNB2Q92953 911 aa26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 CACNA1FO60840 1977 aa26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPATA32Q96LK8 384 aa26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC25Q9H1X3 360 aa26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms