RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312233.4

GLIS1-201, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-201ENST00000312233 SASH3O75995 380 aa20.6■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 MAP2K2P36507 400 aa20.6■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 ARID5BQ14865 1188 aa20.6■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC93Q567U6 631 aa20.6■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 CEP89Q96ST8 783 aa20.6■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 CBX8Q9HC52 389 aa20.6■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 GOLIM4O00461 696 aa20.59■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 ERC2O15083 957 aa20.59■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 IRF6O14896 467 aa20.59■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 IVLP07476 585 aa20.59■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 TYRO3Q06418 890 aa20.59■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 RTL1A6NKG5 1358 aa20.59■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.59■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.59■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.58■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 IQGAP1P46940 1657 aa20.58■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 SKILP12757 684 aa20.58■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 TBC1D8O95759 1140 aa20.58■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 SGSM3Q96HU1 749 aa20.58■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.58■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 STK26Q9P289 416 aa20.57■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.57■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 NEMFO60524 1076 aa20.57■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 MROH2AA6NES4 1674 aa20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF853P0CG23 659 aa20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 CORO7P57737 925 aa20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 RAI14Q9P0K7 980 aa20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 KIF1BO60333 1816 aa20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.55■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 CDC25BP30305 580 aa20.55■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 ANO6Q4KMQ2 910 aa20.55■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.55■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 CPP00450 1065 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 MAP3K11Q16584 847 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 KCND1Q9NSA2 647 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 PIK3C2BO00750 1634 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 CCZ1BP86790 482 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 UBXN4Q92575 508 aa20.54■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 ADGRB3O60242 1522 aa20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 PALD1Q9ULE6 856 aa20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 RGS12O14924 1447 aa20.53■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.52■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 HOMEZQ8IX15 550 aa20.52■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 MORC1Q86VD1 984 aa20.52■□□□□ 0.88
GLIS1-201ENST00000312233 ERVK-7P63135 1459 aa20.52■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 RPS6KA5O75582 802 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 CAMK4Q16566 473 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 ADGRB2O60241 1585 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 F13A1P00488 732 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 MCCP23508 829 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 DCTPP1Q9H773 170 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.51■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC69A6NI79 296 aa20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.5■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 STX6O43752 255 aa20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 SYT1P21579 422 aa20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.49■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 PIK3R4Q99570 1358 aa20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 MTHFSP49914 203 aa20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 H3BQF6 201 aa20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 RPAINQ86UA6 219 aa20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 MYOM2P54296 1465 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 IDI1Q13907 227 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 MADDQ8WXG6 1647 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 TRDNQ13061 729 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 PPP2R5AQ15172 486 aa20.47■□□□□ 0.87
GLIS1-201ENST00000312233 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms