RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310252.11

TTLL3-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 1,561 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-201ENST00000310252 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.64□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.64□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 F6X3S4 739 aa14.64□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 ZPR1O75312 459 aa14.64□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.64□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 KSR2Q6VAB6 950 aa14.64□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.64□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.64□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.64□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 C4BP0C0L5 1744 aa14.63□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 TRIM27P14373 513 aa14.63□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 SSFA2P28290 1259 aa14.63□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.63□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 ADRA2BP18089 450 aa14.62□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.62□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 TNNQ9UQP3 1299 aa14.62□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 MS4A1P11836 297 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 NARFQ9UHQ1 456 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 CAMTA2O94983 1202 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 HLFQ16534 295 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 PANK1Q8TE04 598 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 MYD88Q99836 296 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 ADCY9O60503 1353 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-201ENST00000310252 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 RLBP1P12271 317 aa14.57□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 TCIRG1Q13488 830 aa14.57□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 PDE3AQ14432 1141 aa14.57□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.57□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.57□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.57□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.57□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 GPTP24298 496 aa14.56□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.56□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 COG6Q9Y2V7 657 aa14.56□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 RREB1Q92766 1687 aa14.56□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 ABCC4O15439 1325 aa14.56□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 BEND3Q5T5X7 828 aa14.56□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.56□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 FAM177BA6PVY3 158 aa14.55□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 GYS1P13807 737 aa14.55□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 LINS1Q8NG48 757 aa14.55□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.55□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.54□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 IGKV5-2P06315 115 aa14.54□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.54□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 SETDB2Q96T68 719 aa14.54□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.53□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 ALDH1L1O75891 902 aa14.53□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 MSL1Q68DK7 614 aa14.53□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.53□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 RGL2O15211 777 aa14.52□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.52□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.52□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 CRBNQ96SW2 442 aa14.52□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.52□□□□□ -0.08
TTLL3-201ENST00000310252 NPHP1O15259 732 aa14.51□□□□□ -0.09
TTLL3-201ENST00000310252 GCKRQ14397 625 aa14.51□□□□□ -0.09
TTLL3-201ENST00000310252 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.51□□□□□ -0.09
TTLL3-201ENST00000310252 ATP10DQ9P241 1426 aa14.51□□□□□ -0.09
TTLL3-201ENST00000310252 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TTLL3-201ENST00000310252 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TTLL3-201ENST00000310252 NFIXQ14938 502 aa14.51□□□□□ -0.09
TTLL3-201ENST00000310252 PARP10Q53GL7 1025 aa14.51□□□□□ -0.09
TTLL3-201ENST00000310252 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TTLL3-201ENST00000310252 SUSD4Q5VX71 490 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms