RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308271.13

USP48-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP48, Length 4,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48-201ENST00000308271 PTGS1P23219 599 aa22.49■■□□□ 1.19
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USP48-201ENST00000308271 WASF1Q92558 559 aa22.49■■□□□ 1.19
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USP48-201ENST00000308271 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
USP48-201ENST00000308271 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.44■■□□□ 1.18
USP48-201ENST00000308271 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.44■■□□□ 1.18
USP48-201ENST00000308271 ADAMTS12P58397 1594 aa22.44■■□□□ 1.18
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USP48-201ENST00000308271 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.43■■□□□ 1.18
USP48-201ENST00000308271 BIN1O00499 593 aa22.43■■□□□ 1.18
USP48-201ENST00000308271 MCM3P25205 808 aa22.43■■□□□ 1.18
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USP48-201ENST00000308271 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.42■■□□□ 1.18
USP48-201ENST00000308271 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.42■■□□□ 1.18
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USP48-201ENST00000308271 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.4■■□□□ 1.18
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USP48-201ENST00000308271 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.37■■□□□ 1.17
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USP48-201ENST00000308271 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.37■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.37■■□□□ 1.17
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USP48-201ENST00000308271 USP19O94966 1318 aa22.36■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 SHTN1A0MZ66 631 aa22.36■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.36■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 MSH6P52701 1360 aa22.36■■□□□ 1.17
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