RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299705.9

TMED3-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED3, Length 1,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3-201ENST00000299705 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.97■■□□□ 1.27
TMED3-201ENST00000299705 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.97■■□□□ 1.27
TMED3-201ENST00000299705 ZPR1O75312 459 aa22.96■■□□□ 1.27
TMED3-201ENST00000299705 CAMTA2O94983 1202 aa22.96■■□□□ 1.27
TMED3-201ENST00000299705 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TMED3-201ENST00000299705 ARXQ96QS3 562 aa22.96■■□□□ 1.27
TMED3-201ENST00000299705 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TMED3-201ENST00000299705 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TMED3-201ENST00000299705 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 BCORQ6W2J9 1755 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 KSR2Q6VAB6 950 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 SCN7AQ01118 1682 aa22.94■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 ADCY9O60503 1353 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 MSH5O43196 834 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 GYS1P13807 737 aa22.91■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 HLFQ16534 295 aa22.91■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.91■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.91■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.91■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.91■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.91■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.9■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 NUP98P52948 1817 aa22.89■■□□□ 1.26
TMED3-201ENST00000299705 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.89■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 CASZ1Q86V15 1759 aa22.89■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 TRIM27P14373 513 aa22.88■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 TCIRG1Q13488 830 aa22.88■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.88■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 F6X3S4 739 aa22.87■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 ATP10DQ9P241 1426 aa22.87■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 FKBP8Q14318 412 aa22.86■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.86■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.86■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 MS4A1P11836 297 aa22.85■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.85■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.85■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.85■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.85■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 ABCC4O15439 1325 aa22.84■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 BEND3Q5T5X7 828 aa22.84■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.84■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 LINS1Q8NG48 757 aa22.84■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 MYD88Q99836 296 aa22.84■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 PLIN1O60240 522 aa22.83■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 TM4SF1P30408 202 aa22.83■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.83■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
TMED3-201ENST00000299705 MTFR1LQ9H019 292 aa22.82■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 IGKV5-2P06315 115 aa22.81■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 PDE3AQ14432 1141 aa22.81■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 NFIXQ14938 502 aa22.81■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 PARP10Q53GL7 1025 aa22.81■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 SETDB2Q96T68 719 aa22.81■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 TNNQ9UQP3 1299 aa22.81■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.8■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 ALDH1L1O75891 902 aa22.8■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.8■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.8■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.8■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.8■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.79■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 GPTP24298 496 aa22.79■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 NLRP10Q86W26 655 aa22.79■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.79■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.79■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 MSL1Q68DK7 614 aa22.79■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.79■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 ZBTB7AO95365 584 aa22.78■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 RLBP1P12271 317 aa22.77■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.77■■□□□ 1.24
TMED3-201ENST00000299705 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms