RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MetP16056 1379 aa24.63■■□□□ 1.53
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AK157302I3ITR1 129 aa24.62■■□□□ 1.53
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Isca1Q9D924 129 aa24.62■■□□□ 1.53
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa24.61■■□□□ 1.53
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gnat3Q3V3I2 354 aa24.61■■□□□ 1.53
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sptbn5F6UCX4 1208 aa24.59■■□□□ 1.53
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cwc25Q9DBF7 416 aa24.59■■□□□ 1.53
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Myd88P22366 296 aa24.54■■□□□ 1.52
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf123Q5XPI3 1314 aa24.53■■□□□ 1.52
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ltbp1Q8CG19 1712 aa24.53■■□□□ 1.52
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam213aQ9CYH2 218 aa24.51■■□□□ 1.51
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa24.51■■□□□ 1.51
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Smc4Q8CG47 1286 aa24.51■■□□□ 1.51
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Adora1Q60612 326 aa24.5■■□□□ 1.51
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pde3bQ61409 1100 aa24.49■■□□□ 1.51
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Erc2Q6PH08 957 aa24.49■■□□□ 1.51
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NexnQ7TPW1 607 aa24.48■■□□□ 1.51
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa24.47■■□□□ 1.51
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mre11Q61216 706 aa24.47■■□□□ 1.51
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MypopQ8R4U1 393 aa24.47■■□□□ 1.51
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Greb1lB9EJV3 1913 aa24.45■■□□□ 1.5
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa24.45■■□□□ 1.5
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam228bQ497Q6 232 aa24.45■■□□□ 1.5
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa24.45■■□□□ 1.5
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Taf5lQ91WQ5 589 aa24.44■■□□□ 1.5
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa24.44■■□□□ 1.5
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Unc5clQ6R653 518 aa24.43■■□□□ 1.5
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Myt1Q8CFC2 1127 aa24.43■■□□□ 1.5
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa24.43■■□□□ 1.5
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nyap1Q6PFX7 833 aa24.43■■□□□ 1.5
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 GorabQ8BRM2 368 aa24.43■■□□□ 1.5
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q8C5K5 320 aa24.43■■□□□ 1.5
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa24.41■■□□□ 1.5
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc26a8Q8R0C3 999 aa24.39■■□□□ 1.49
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Col22a1E9Q7P1 1613 aa24.38■■□□□ 1.49
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyp19a1P28649 503 aa24.38■■□□□ 1.49
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa24.38■■□□□ 1.49
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ttc19Q8CC21 365 aa24.37■■□□□ 1.49
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Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 EngaseQ8BX80 734 aa24.37■■□□□ 1.49
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